RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC7Q96M83 1385 aa9.68□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 PDE4AP27815 886 aa9.67□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.67□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.66□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 HFM1A2PYH4 1435 aa9.66□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 24.7
CSDE1-201ENST00000261443 NCOA1Q15788 1441 aa9.66□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.65□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 P3H3Q8IVL6 736 aa9.65□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.65□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 BACH2Q9BYV9 841 aa9.65□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.64□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 PTPRKQ15262 1439 aa9.64□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.64□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.63□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.63□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 GRIN2BQ13224 1484 aa9.62□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.62□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 MS4A1P11836 297 aa9.62□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 NFKBIBQ15653 356 aa9.62□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 NAIPQ13075 1403 aa9.62□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 FMN1Q68DA7 1419 aa9.61□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 PBRM1Q86U86 1689 aa9.61□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.61□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.61□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.61□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 ARHGEF11O15085 1522 aa9.6□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.6□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.6□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.59□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CSDE1-201ENST00000261443 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 SLC4A3P48751 1232 aa9.56□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 ADAMTS12P58397 1594 aa9.56□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.56□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 TMC1Q8TDI8 760 aa9.56□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.56□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.55□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.55□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.55□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 KDM6BO15054 1643 aa9.54□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.54□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.54□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.54□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 HECW1Q76N89 1606 aa9.54□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.53□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.53□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.53□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 FOXD1Q16676 465 aa9.52□□□□□ -0.88
CSDE1-201ENST00000261443 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.52□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.52□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 SKAP1Q86WV1 359 aa9.51□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 WDR62O43379 1518 aa9.5□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.5□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 IQGAP2Q13576 1575 aa9.5□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.48□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.48□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.48□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 DISP1Q96F81 1524 aa9.47□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 MIA2Q96PC5 1412 aa9.47□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 PLIN1O60240 522 aa9.47□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 ZMYND15Q9H091 742 aa9.46□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.46□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 PDE3BQ13370 1112 aa9.46□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 CRBNQ96SW2 442 aa9.46□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.45□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 FAM161AQ3B820 660 aa9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 KIAA0556O60303 1618 aa9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 USP47Q96K76 1375 aa9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 KIF15Q9NS87 1388 aa9.44□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.43□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 C8orf34Q49A92 452 aa9.43□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CSDE1-201ENST00000261443 POGKQ9P215 609 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms