RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 NRDCO43847 1150 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 PKD2Q13563 968 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 HMGXB3Q12766 1538 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 NUP155O75694 1391 aa11.54□□□□□ -0.56
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PTPRB-201ENST00000261266 KIF15Q9NS87 1388 aa11.53□□□□□ -0.56
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PTPRB-201ENST00000261266 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.52□□□□□ -0.57
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PTPRB-201ENST00000261266 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.51□□□□□ -0.57
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PTPRB-201ENST00000261266 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.47□□□□□ -0.57
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PTPRB-201ENST00000261266 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRB-201ENST00000261266 MIA2Q96PC5 1412 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRB-201ENST00000261266 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRB-201ENST00000261266 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRB-201ENST00000261266 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 NLRP13Q86W25 1043 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 EID1Q9Y6B2 187 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 PTPRGP23470 1445 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 AAMPQ13685 434 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 GPATCH3Q96I76 525 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 HMMRO75330 724 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 IFT140Q96RY7 1462 aa11.43□□□□□ -0.58
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PTPRB-201ENST00000261266 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.43□□□□□ -0.58
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PTPRB-201ENST00000261266 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 GRIN2BQ13224 1484 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 JPH4Q96JJ6 628 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.41□□□□□ -0.58
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PTPRB-201ENST00000261266 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 HECW1Q76N89 1606 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRB-201ENST00000261266 KCNJ4P48050 445 aa11.4□□□□□ -0.58
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PTPRB-201ENST00000261266 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 TOP2BQ02880 1626 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 FGD1P98174 961 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.38□□□□□ -0.59
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PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.38□□□□□ -0.59
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PTPRB-201ENST00000261266 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 STK31Q9BXU1 1019 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 IGF1RP08069 1367 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 NEUROD2Q15784 382 aa11.37□□□□□ -0.59
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PTPRB-201ENST00000261266 GGT6Q6P531 493 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 ROCK1Q13464 1354 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 KIF3BO15066 747 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 RGS3P49796 1198 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0G2JS52 829 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 TPM4P67936 248 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 SYNJ2O15056 1496 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRB-201ENST00000261266 USP35Q9P2H5 1018 aa11.33□□□□□ -0.59
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