RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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ODC1-201ENST00000234111 BACH2Q9BYV9 841 aa28.42■■■□□ 2.14
ODC1-201ENST00000234111 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.4■■■□□ 2.14
ODC1-201ENST00000234111 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.39■■■□□ 2.14
ODC1-201ENST00000234111 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.38■■■□□ 2.13
ODC1-201ENST00000234111 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.37■■■□□ 2.13
ODC1-201ENST00000234111 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.36■■■□□ 2.13
ODC1-201ENST00000234111 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.33■■■□□ 2.12
ODC1-201ENST00000234111 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-201ENST00000234111 FOXD1Q16676 465 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-201ENST00000234111 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.32■■■□□ 2.12
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ODC1-201ENST00000234111 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-201ENST00000234111 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.29■■■□□ 2.12
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ODC1-201ENST00000234111 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.23■■■□□ 2.11
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ODC1-201ENST00000234111 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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ODC1-201ENST00000234111 FAM161AQ3B820 660 aa27.81■■■□□ 2.04
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ODC1-201ENST00000234111 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.79■■■□□ 2.04
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ODC1-201ENST00000234111 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
ODC1-201ENST00000234111 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa27.74■■■□□ 2.03
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
ODC1-201ENST00000234111 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
ODC1-201ENST00000234111 NLRP13Q86W25 1043 aa27.72■■■□□ 2.03
ODC1-201ENST00000234111 ROCK1Q13464 1354 aa27.69■■■□□ 2.02
ODC1-201ENST00000234111 DAPK1P53355 1430 aa27.68■■■□□ 2.02
ODC1-201ENST00000234111 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.68■■■□□ 2.02
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