RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222329.8

ERF-201, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERF, Length 2,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-201ENST00000222329 SYNJ2O15056 1496 aa32.13■■■□□ 2.73
ERF-201ENST00000222329 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
ERF-201ENST00000222329 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
ERF-201ENST00000222329 ANP32CO43423 234 aa32.12■■■□□ 2.73
ERF-201ENST00000222329 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.12■■■□□ 2.73
ERF-201ENST00000222329 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.09■■■□□ 2.73
ERF-201ENST00000222329 MYT1Q01538 1121 aa32.08■■■□□ 2.73
ERF-201ENST00000222329 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
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ERF-201ENST00000222329 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
ERF-201ENST00000222329 AKNAQ7Z591 1439 aa32.04■■■□□ 2.72
ERF-201ENST00000222329 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
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ERF-201ENST00000222329 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
ERF-201ENST00000222329 ROCK1Q13464 1354 aa31.95■■■□□ 2.71
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ERF-201ENST00000222329 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
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ERF-201ENST00000222329 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.93■■■□□ 2.7
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ERF-201ENST00000222329 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.91■■■□□ 2.7
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ERF-201ENST00000222329 CCER2I3L3R5 266 aa31.89■■■□□ 2.7
ERF-201ENST00000222329 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
ERF-201ENST00000222329 BCANQ96GW7 911 aa31.86■■■□□ 2.69
ERF-201ENST00000222329 NCOA1Q15788 1441 aa31.84■■■□□ 2.69
ERF-201ENST00000222329 ATP10BO94823 1461 aa31.81■■■□□ 2.68
ERF-201ENST00000222329 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
ERF-201ENST00000222329 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
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ERF-201ENST00000222329 PZPP20742 1482 aa31.75■■■□□ 2.67
ERF-201ENST00000222329 FKBP8Q14318 412 aa31.74■■■□□ 2.67
ERF-201ENST00000222329 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.74■■■□□ 2.67
ERF-201ENST00000222329 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.71■■■□□ 2.67
ERF-201ENST00000222329 ABCA8O94911 1581 aa31.71■■■□□ 2.67
ERF-201ENST00000222329 PTPRGP23470 1445 aa31.7■■■□□ 2.67
ERF-201ENST00000222329 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.7■■■□□ 2.67
ERF-201ENST00000222329 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 CCDC184Q52MB2 194 aa31.68■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.67■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.66■■■□□ 2.66
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ERF-201ENST00000222329 TSPY10P0CW01 314 aa31.66■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.65■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.64■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.64■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.64■■■□□ 2.66
ERF-201ENST00000222329 NUP155O75694 1391 aa31.63■■■□□ 2.65
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ERF-201ENST00000222329 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.61■■■□□ 2.65
ERF-201ENST00000222329 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.61■■■□□ 2.65
ERF-201ENST00000222329 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.59■■■□□ 2.65
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ERF-201ENST00000222329 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.56■■■□□ 2.64
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ERF-201ENST00000222329 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.55■■■□□ 2.64
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ERF-201ENST00000222329 CHD1O14646 1710 aa31.5■■■□□ 2.63
ERF-201ENST00000222329 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
ERF-201ENST00000222329 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.49■■■□□ 2.63
ERF-201ENST00000222329 NEFLP07196 543 aa31.49■■■□□ 2.63
ERF-201ENST00000222329 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.44■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 MRS2Q9HD23 443 aa31.43■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 MBD5Q9P267 1494 aa31.42■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 USP47Q96K76 1375 aa31.41■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.4■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.4■■■□□ 2.62
ERF-201ENST00000222329 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.37■■■□□ 2.61
ERF-201ENST00000222329 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.37■■■□□ 2.61
ERF-201ENST00000222329 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.37■■■□□ 2.61
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ERF-201ENST00000222329 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.3■■■□□ 2.6
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ERF-201ENST00000222329 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.29■■■□□ 2.6
ERF-201ENST00000222329 PREX2Q70Z35 1606 aa31.26■■■□□ 2.59
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ERF-201ENST00000222329 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.25■■■□□ 2.59
ERF-201ENST00000222329 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.591e-6■■■□□ 16.9
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ERF-201ENST00000222329 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.2■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 SHROOM2Q13796 1616 aa31.18■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 KDM5CP41229 1560 aa31.18■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.17■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 ABCC2Q92887 1545 aa31.15■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.15■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.14■■■□□ 2.58
ERF-201ENST00000222329 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.14■■■□□ 2.58
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