RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NexmifQ5DTT1 1515 aa47,24■■■■■ 5,15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP47,16■■■■■ 5,14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa47,12■■■■■ 5,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttc37F8VPK0 1563 aa47,1■■■■■ 5,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa47,06■■■■■ 5,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 A2mQ6GQT1 1474 aa47,06■■■■■ 5,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfyve16Q80U44 1528 aa47,02■■■■■ 5,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccnb3Q810T2 1396 aa47,01■■■■■ 5,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Depdc5P61460 1591 aa47,01■■■■■ 5,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AglF8VPN4 1532 aa46,92■■■■■ 5,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnf17Q99MV7 1640 aa46,9■■■■■ 5,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa46,9■■■■■ 5,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AdgbG3UZ78 1657 aa46,85■■■■■ 5,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgap5P97393 1501 aa46,81■■■■■ 5,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adcy10Q8C0T9 1614 aa46,78■■■■■ 5,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Caskin1Q6P9K8 1431 aa46,78■■■■■ 5,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tdrd9Q14BI7 1383 aa46,72■■■■■ 5,07
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa46,71■■■■■ 5,07
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abca9Q8K449 1623 aa46,67■■■■■ 5,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP46,66■■■■■ 5,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cfap74Q3UY96 1578 aa46,6■■■■■ 5,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 UbtfP25976 765 aaKnown RBP46,57■■■■■ 5,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa46,56■■■■■ 5,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fndc1E9Q043 1732 aa46,56■■■■■ 5,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa46,54■■■■■ 5,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trappc8E9PWG2 1437 aa46,54■■■■■ 5,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP46,53■■■■■ 5,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP46,52■■■■■ 5,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc3B2RX12 1523 aa46,52■■■■■ 5,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa46,46■■■■■ 5,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kidins220E9Q9B7 1793 aa46,44■■■■■ 5,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lemd3Q9WU40 921 aa46,43■■■■■ 5,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP46,36■■■■■ 5,01
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kiaa0556Q8C753 1610 aa46,35■■■■■ 5,01
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc5Q9R1X5 1436 aa46,35■■■■■ 5,01
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 OvosQ3UU35 1456 aa46,32■■■■■ 5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plekhh2Q8C115 1491 aa46,29■■■■■ 5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mtus2Q3UHD3 1353 aa46,29■■■■■ 5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa46,28■■■■■ 5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Synj2Q9D2G5 1434 aa46,27■■■■■ 5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm5cP41230 1554 aa46,16■■■■■ 4,98
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hecw2Q6I6G8 1578 aa46,16■■■■■ 4,98
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hecw1Q8K4P8 1604 aa46,15■■■■■ 4,98
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cabp1Q9JLK7 227 aa46,13■■■■■ 4,97
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il16O54824 1322 aa46,12■■■■■ 4,97
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa46,11■■■■■ 4,97
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp10aO54827 1508 aa46,08■■■■■ 4,97
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chic2Q9D9G3 165 aa46,05■■■■■ 4,96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Neurl4Q5NCX5 1563 aa46,04■■■■■ 4,96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Naip2Q9QUK4 1447 aa46,04■■■■■ 4,96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ptch1Q61115 1434 aa46,03■■■■■ 4,96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mast1Q9R1L5 1570 aa46,02■■■■■ 4,96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP46,01■■■■■ 4,96
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dnajc5gQ8C632 165 aa46■■■■■ 4,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 UacaQ8CGB3 1411 aa45,98■■■■■ 4,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prdm16A2A935 1275 aa45,97■■■■■ 4,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SphkapQ6NSW3 1687 aa45,95■■■■■ 4,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dip2cE9PWR4 1557 aa45,95■■■■■ 4,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fmn2Q9JL04 1578 aa45,94■■■■■ 4,95
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP45,93■■■■■ 4,94
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RereQ80TZ9 1558 aa45,92■■■■■ 4,94
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Map3k5O35099 1380 aa45,91■■■■■ 4,94
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa45,89■■■■■ 4,94
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Yeats2Q3TUF7 1407 aa45,88■■■■■ 4,94
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plppr3Q7TPB0 716 aa45,87■■■■■ 4,93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa45,87■■■■■ 4,93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nos1Q9Z0J4 1429 aa45,86■■■■■ 4,93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rfx7F8VPJ6 1459 aa45,83■■■■■ 4,93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa45,82■■■■■ 4,93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mia2Q91ZV0 1396 aa45,8■■■■■ 4,92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NclP09405 707 aaKnown RBP45,79■■■■■ 4,92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cul9Q80TT8 1865 aa45,76■■■■■ 4,92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP45,73■■■■■ 4,91
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP45,73■■■■■ 4,91
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fhod3Q76LL6 1578 aa45,71■■■■■ 4,91
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NpatQ8BMA5 1420 aa45,71■■■■■ 4,91
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa45,69■■■■■ 4,9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Qser1A2BIE1 1698 aa45,68■■■■■ 4,9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fhad1A6PWD2 1420 aa45,64■■■■■ 4,9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP45,64■■■■■ 4,9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Alpk3Q924C5 1678 aa45,63■■■■■ 4,9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP45,61■■■■■ 4,89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP45,6■■■■■ 4,89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa45,6■■■■■ 4,89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ssh2Q5SW75 1423 aa45,59■■■■■ 4,89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vps8Q0P5W1 1427 aa45,58■■■■■ 4,89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gli2Q0VGT2 1544 aa45,53■■■■■ 4,88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Naip6Q9JIB6 1403 aa45,51■■■■■ 4,88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abca17E9PX95 1733 aa45,51■■■■■ 4,88
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif3bQ61771 747 aa45,5■■■■■ 4,87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trpm1Q2TV84 1622 aa45,49■■■■■ 4,87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa45,46■■■■■ 4,87
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plch2A2AP18 1501 aa45,44■■■■■ 4,86
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cfap65Q3V0B4 1847 aa45,43■■■■■ 4,86
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mier1Q5UAK0 511 aa45,41■■■■■ 4,86
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Camsap2Q8C1B1 1461 aa45,39■■■■■ 4,86
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa45,39■■■■■ 4,86
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP45,38■■■■■ 4,86
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AlkP97793 1621 aa45,38■■■■■ 4,85
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Uggt2E9Q4X2 1504 aa45,36■■■■■ 4,85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,9 ms