RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Neo1P97798 1493 aa30.34■■■□□ 2.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NclP09405 707 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mtus2Q3UHD3 1353 aa30.31■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Il16O54824 1322 aa30.3■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ube2uB1AUC4 352 aa30.29■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Jph4Q80WT0 628 aa30.29■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cabp1Q9JLK7 227 aa30.28■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa30.28■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Camsap2Q8C1B1 1461 aa30.27■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa30.26■■■□□ 2.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Setbp1Q9Z180 1582 aa30.26■■■□□ 2.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prex2Q3LAC4 1598 aa30.25■■■□□ 2.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Caskin1Q6P9K8 1431 aa30.23■■■□□ 2.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa30.23■■■□□ 2.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AknaQ80VW7 1404 aa30.21■■■□□ 2.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fancd2Q80V62 1450 aa30.19■■■□□ 2.42
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mphosph9A6H5Y1 991 aa30.17■■■□□ 2.42
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SphkapQ6NSW3 1687 aa30.15■■■□□ 2.42
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Naip5Q9R016 1403 aa30.13■■■□□ 2.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm14025A2AP89 1413 aa30.12■■■□□ 2.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Neurod1Q60867 357 aa30.07■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa30.05■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm13697A2AK42 830 aa30.05■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif21bQ9QXL1 1668 aa30.05■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa30.03■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa30.03■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tdrd9Q14BI7 1383 aa30.03■■■□□ 2.4
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AlkP97793 1621 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr7Q920I9 1489 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc1O35379 1528 aa29.99■■■□□ 2.39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fmn2Q9JL04 1578 aa29.96■■■□□ 2.39
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rnf17Q99MV7 1640 aa29.96■■■□□ 2.39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Chd1P40201 1711 aa29.94■■■□□ 2.38
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zfp644E9QA22 1323 aa29.93■■■□□ 2.38
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NhsB1AV60 1647 aa29.93■■■□□ 2.38
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pkd2O35245 966 aa29.92■■■□□ 2.38
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pik3c2gO70167 1506 aa29.9■■■□□ 2.38
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa29.88■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trpm2Q91YD4 1506 aa29.88■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cfap74Q3UY96 1578 aa29.88■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Usp47Q8BY87 1376 aa29.88■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa29.87■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgap5P97393 1501 aa29.86■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Neurl4Q5NCX5 1563 aa29.85■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mast1Q9R1L5 1570 aa29.84■■■□□ 2.37
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
Ube2b-201ENSMUST00000020657 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Anks4bQ8K3X6 423 aa29.8■■■□□ 2.36
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pprc1Q6NZN1 1644 aa29.79■■■□□ 2.36
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hecw1Q8K4P8 1604 aa29.77■■■□□ 2.36
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abca8bQ8K440 1620 aa29.76■■■□□ 2.36
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa29.73■■■□□ 2.35
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ttll5Q8CHB8 1328 aa29.73■■■□□ 2.35
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Igf1rQ60751 1373 aa29.71■■■□□ 2.35
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.7■■■□□ 2.34
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc3B2RX12 1523 aa29.69■■■□□ 2.34
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Clstn2Q9ER65 966 aa29.68■■■□□ 2.34
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trappc8E9PWG2 1437 aa29.68■■■□□ 2.34
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trak1Q6PD31 939 aa29.62■■■□□ 2.33
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ssh2Q5SW75 1423 aa29.62■■■□□ 2.33
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PtprgQ05909 1442 aa29.61■■■□□ 2.33
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mbd5B1AYB6 1498 aa29.57■■■□□ 2.32
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prdm16A2A935 1275 aa29.56■■■□□ 2.32
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa29.52■■■□□ 2.32
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ncoa1P70365 1447 aa29.52■■■□□ 2.32
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AI481877A2ALV5 1481 aa29.49■■■□□ 2.31
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29.48■■■□□ 2.31
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rock1P70335 1354 aa29.47■■■□□ 2.31
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kidins220E9Q9B7 1793 aa29.45■■■□□ 2.31
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stra8P70278 393 aa29.45■■■□□ 2.31
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Asxl1P59598 1514 aa29.45■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Znf608Q56A10 1511 aa29.45■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa29.44■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29.44■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rgl3Q3UYI5 709 aa29.44■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PtprtQ99M80 1454 aa29.43■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myom3A2ABU4 1439 aa29.4■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cd109Q8R422 1442 aa29.4■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dapk1Q80YE7 1442 aa29.4■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mug2P28666 1451 aa29.39■■■□□ 2.3
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