RNA–Protein interactions for RNA: YPL237W

SUI3, Transcript of Beta subunit of the translation initiation factor eIF2, yeast

Gene SUI3, Length 858 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUI3	YPL237W	SNG1	P46950	547 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUI3	YPL237W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SUI3	YPL237W	YNL181W	P53878	407 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUI3	YPL237W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SUI3	YPL237W	NUP100	Q02629	959 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUI3	YPL237W	SFI1	Q12369	946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUI3	YPL237W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	ELO2	P25358	347 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	PMT1	P33775	817 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	ASK1	P35734	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	CMC1	P36064	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YPK3	P38070	525 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	MUM2	P38236	366 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	TWF1	P53250	332 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	ESBP6	P53918	673 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	TOF2	Q02208	771 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	UBX3	Q12229	455 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	NUP170	P38181	1502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	BYE1	P36106	594 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	LAG1	P38703	411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	PCL6	P40038	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SNT2	P53127	1403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SEC39	Q12745	709 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	GID7	P25569	745 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SNC1	P31109	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	NFU1	P32860	256 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	RTS2	P40962	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	IAH1	P41734	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	HXT14	P42833	540 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	STB2	P46679	850 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	AIM22	P47051	409 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SSK1	Q07084	712 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	GEP3	Q08622	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
SUI3	YPL237W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	PHD1	P36093	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	BET4	Q00618	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SHR3	Q02774	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	MLH2	Q07980	695 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	DSE3	Q08729	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	RGT2	Q12300	763 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	PEP5	P12868	1029 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	MGR1	P25573	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SAS3	P34218	831 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SHP1	P34223	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	ERG7	P38604	731 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YHR210C	P38893	341 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	FET5	P43561	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	BUD32	P53323	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	DIC1	Q06143	298 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	THP1	Q08231	455 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	AFT2	Q08957	416 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	CAT8	P39113	1433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	CLB3	P24870	427 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	ATO2	P32907	282 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SEC66	P33754	206 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YIL152W	P40455	235 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	SMA1	Q02651	245 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	RSF1	Q05043	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	BSC1	Q12140	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUI3	YPL237W	YBT1	P32386	1661 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	COR1	P07256	457 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	AXL1	P40851	1208 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUI3	YPL237W	SNA4	Q07549	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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