RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	RRT5	P43607	289 aa		1.02	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	BRO1	P48582	844 aa		1.02	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	REG1	Q00816	1014 aa		1.02	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	FDH1	Q08911	376 aa		1.02	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	TPK1	P06244	397 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	NUC1	P08466	329 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	NUP2	P32499	720 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	KKQ8	P36004	724 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	NPR3	P38742	1146 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	PRM5	P40476	318 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	BNA1	P47096	177 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	VHS1	Q03785	461 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	ECM11	Q04110	302 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	PHO92	Q06390	306 aa		1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	1.01	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	MTF2	P10849	440 aa		1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	RAD16	P31244	790 aa		1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	DUG2	P38149	878 aa		1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	ACA1	P39970	489 aa		1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	YJR154W	P47181	346 aa		1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	DSD1	P53095	428 aa		1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	TRM8	Q12009	286 aa		1	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	YBR085C-A	O43137	85 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	MSM1	P22438	575 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	SYN8	P31377	255 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	YKL100C	P34248	587 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	VPS4	P52917	437 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	MRPL13	Q02204	264 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	INA17	Q02888	182 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	MSC1	Q03104	513 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	YKU80	Q04437	629 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
BLI1	YKL061W	SUC2	P00724	532 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	EXO70	P19658	623 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	UTR4	P32626	227 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	SLZ1	P40167	298 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	RIC1	P40395	1056 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	GAB1	P41733	394 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	NCA3	P46955	337 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	DIA1	P54005	336 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	ATP4	P05626	244 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	MRP20	P32387	263 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	ALY1	P36117	915 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	MRPL36	P36531	177 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	IBD2	P53892	351 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	MUB1	Q03162	620 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	YOR365C	Q08844	703 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	NUS1	Q12063	375 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BLI1	YKL061W	SAL1	D6W196	494 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	YLR302C	O13544	120 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	PHO81	P17442	1178 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	DBF20	P32328	564 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	NDI1	P32340	513 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	TOM20	P35180	183 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	GRX7	P38068	203 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	TIM17	P39515	158 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	DIA3	P52290	468 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	RCO1	Q04779	684 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	BLS1	Q06071	122 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	SKG3	Q06315	1026 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	SSP2	Q08646	371 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	YPL272C	Q08984	517 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	ELO2	P25358	347 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	MNS1	P32906	549 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	STB6	P36085	766 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	NUP133	P36161	1157 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	MRPS9	P38120	278 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	MIX23	P38162	196 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	AXL2	P38928	823 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	SNO4	Q04902	237 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	VID22	Q05934	901 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BLI1	YKL061W	YDL057W	Q07379	328 aa		0.95	□□□□□ -2.26

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