RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	BOR1	P53838	576 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YSA1	Q01976	231 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YKU80	Q04437	629 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	ENT1	Q12518	454 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	CDC16	P09798	840 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	HOM3	P10869	527 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	OPI1	P21957	404 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YCK1	P23291	538 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	POL4	P25615	582 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YIH1	P25637	258 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	TOA1	P32773	286 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	NUP133	P36161	1157 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	LYS14	P40971	790 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	LCL3	P53153	274 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YML037C	Q03703	340 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SYO1	Q07395	620 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	HUA2	Q12134	243 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YLL056C	Q12177	298 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YDL009C	Q12210	107 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SCM3	Q12334	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SWI3	P32591	825 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	CIN4	P39110	191 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SHO1	P40073	367 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	IRC6	P43615	237 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
SFT1	YKL006C-A	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SMA2	Q04658	369 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	TLG2	Q08144	397 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	REV1	P12689	985 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	PMU1	P36069	295 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	TUL1	P36096	758 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	PCA1	P38360	1216 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MRPL19	P53875	158 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MSC1	Q03104	513 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	TAF11	Q04226	346 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MFB1	Q04922	465 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	HEM2	P05373	342 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YCR022C	P25620	114 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	FRE1	P32791	686 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	APE4	P38821	490 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	IDP2	P41939	412 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YPI1	P43587	155 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	WSC2	P53832	503 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	IPI3	P53877	555 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	IRC15	Q02733	499 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SLD5	Q03406	294 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	IVY1	Q04934	453 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YLR287C	Q05881	355 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
SFT1	YKL006C-A	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ATR1	P13090	542 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	EXO70	P19658	623 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YBR225W	P38321	900 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YHR210C	P38893	341 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ALG8	P40351	577 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YJR154W	P47181	346 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	VPS74	Q06385	345 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YPL272C	Q08984	517 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SPE4	Q12455	300 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SGS1	P35187	1447 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	MRP13	P12686	339 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RED1	P14291	827 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RPC53	P25441	422 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	NPL6	P32832	435 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ALG5	P40350	334 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SPG5	P42933	373 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RMD8	P43620	662 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YGL242C	P53066	181 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	TOF2	Q02208	771 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	BNA5	Q05979	453 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	THP1	Q08231	455 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	HIF1	Q12373	385 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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