RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	TOS3	P43637	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MSY1	P48527	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	STB4	P50104	949 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YGR066C	P53242	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SEC5	P89102	971 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ESC8	Q08119	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SPE4	Q12455	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GPA1	P08539	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YSP3	P25036	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YIH1	P25637	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	PSO2	P30620	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ELM1	P32801	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	BUD2	P33314	1104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MRX3	P38172	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MMS4	P38257	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	GIP4	P39732	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YIR016W	P40572	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	SWP82	P43554	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	WAR1	Q03631	944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ARG7	Q04728	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	ECM7	Q06200	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	MLH2	Q07980	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	AFT2	Q08957	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	LCB4	Q12246	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	YPT6	Q99260	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIA2	YHR122W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
CIA2	YHR122W	OM45	P16547	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	LHS1	P36016	881 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	YER186C	P40101	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	YJL068C	P40363	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	MET28	P40573	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	YPT11	P48559	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	INA17	Q02888	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	PLM2	Q04383	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	VPS38	Q05919	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	CUR1	Q06469	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	BUD7	Q08754	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ACF2	Q12168	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	CLB3	P24870	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	GPI10	P30777	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	TRM2	P33753	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	YMC2	P38087	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SMF1	P38925	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	MRX1	P40050	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	MET18	P40469	1032 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	LCB2	P40970	561 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	TIM8	P57744	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	RSM28	Q03430	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	RAD33	Q04231	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	CDD1	Q06549	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	RPC25	P35718	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ASG1	P40467	964 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
CIA2	YHR122W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	MAF1	P41910	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SSU1	P41930	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	CTK2	P46962	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SHE10	P53075	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	VID30	P53076	958 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	GAL80	P04387	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	HAP2	P06774	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	MAS1	P10507	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CIA2	YHR122W	SYN8	P31377	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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