RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	RMT2	Q03305	412 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YDR514C	Q04408	483 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARP9	Q05123	467 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YDR286C	Q05530	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MHR1	Q06630	226 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	FMP16	Q12497	93 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	STE3	P06783	470 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MPH2	P0CD99	609 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ERR1	P0CX10	437 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ERR2	P0CX11	437 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TOP3	P13099	656 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CNB1	P25296	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARA1	P38115	344 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MSG5	P38590	489 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YHR182W	P38870	785 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YHR202W	P38887	602 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MNN1	P39106	762 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TOK1	P40310	691 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YIL166C	P40445	542 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YDL183C	P48569	320 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TAF6	P53040	516 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RTA1	P53047	317 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SWC4	P53201	476 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CWC27	Q02770	301 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YMD8	Q03697	442 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CSI1	Q04368	295 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RTT109	Q07794	436 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SLD7	Q08457	257 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NPP1	P25353	742 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	DBF20	P32328	564 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PPS1	P38148	807 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RFC3	P38629	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SUR2	P38992	349 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGR210C	P42942	411 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GTO1	P48239	356 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NIT3	P49954	291 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CTF18	P49956	741 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGL117W	P53133	265 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GET1	P53192	235 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARP4	P80428	489 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SED5	Q01590	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	FMN1	Q03778	218 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SNX41	Q04053	625 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SMP3	Q04174	516 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	DLT1	Q04216	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CIA1	Q05583	330 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	THI73	Q07904	523 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GAL10	P04397	699 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARG81	P05085	880 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MAS1	P10507	462 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GAL3	P13045	520 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ABF1	P14164	731 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	OM45	P16547	393 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NDC1	P32500	655 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	HES1	P35843	434 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	BET3	P36149	193 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
DOA4	YDR069C	YHR045W	P38775	560 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	FRT2	P39734	528 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SAW1	P39735	261 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YMR134W	P40207	237 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ALG8	P40351	577 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TMA108	P40462	946 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MND2	P40577	368 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	COG1	P53079	417 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CUL3	P53202	744 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGR042W	P53227	271 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RTT103	Q05543	409 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	COQ9	Q05779	260 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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