RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	YLR422W	Q06409	1932 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TOR1	P35169	2470 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MAS1	P10507	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PEX1	P24004	1043 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PGS1	P25578	521 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YCL068C	P25593	260 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PHA2	P32452	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CYM1	P32898	989 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YKR051W	P36142	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RDH54	P38086	958 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ECM13	P38195	257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TDP1	P38319	544 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DSS1	P39112	969 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YTA6	P40328	754 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YFL040W	P43562	540 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	AIM23	P47015	356 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TIM54	P47045	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DIE2	P50076	525 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SAP4	P53036	818 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	GND2	P53319	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
PDI1	YCL043C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YMR209C	Q03648	457 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SWC7	Q06707	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MDM36	Q06820	579 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SLD7	Q08457	257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YDL109C	Q12103	647 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HOS1	Q12214	470 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SVS1	Q12254	260 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	COX5A	P00424	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RHO2	P06781	192 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
PDI1	YCL043C	APE1	P14904	514 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CBS2	P14905	389 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PRI2	P20457	528 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	VAC17	P25591	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RAD27	P26793	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PEX6	P33760	1030 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SKG1	P36169	355 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	STP2	P38704	541 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YHI9	P38765	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YIR016W	P40572	265 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RTT101	P47050	842 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HOC1	P47124	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	EFM3	P47163	339 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MRX6	P48564	524 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MPS2	P53159	387 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CLD1	P53264	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	VAC7	P53950	1165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YNL033W	P53964	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YNL019C	P53975	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MRPL13	Q02204	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SGT1	Q08446	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ATG31	Q12421	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	FMP16	Q12497	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	AFI1	Q99222	893 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HIP1	P06775	603 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	INO1	P11986	533 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DIT1	P21623	536 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	KIN3	P22209	435 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	THI4	P32318	326 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	NDI1	P32340	513 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	FUI1	P38196	639 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	IST2	P38250	946 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	JHD1	P40034	492 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ELO3	P40319	345 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	BST1	P43571	1029 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
PDI1	YCL043C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MDE1	P47095	244 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DIA3	P52290	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MET13	P53128	600 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PEX8	P53248	589 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ZRG17	P53735	605 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DID2	P69771	204 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ECM9	Q02202	377 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PIR3	Q03180	325 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CDC123	Q05791	360 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ENT4	Q07872	247 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PGC1	Q08959	321 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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