RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TOF1	P53840	1238 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TMA16	Q08687	178 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TAO3	P40468	2376 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CHO1	P08456	276 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	PET111	P08468	800 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MAS2	P11914	482 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	OM45	P16547	393 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MSH1	P25846	959 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SPC72	P39723	622 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YJL070C	P40361	888 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TOS3	P43637	560 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	ATG27	P46989	271 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	ARP10	Q04549	284 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TCO89	Q08921	799 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	BSC1	Q12140	328 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RAP1	P11938	827 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RPC53	P25441	422 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YSC83	P32792	385 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YET1	P35723	206 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MIC60	P36112	540 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	AFG3	P39925	761 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MRX1	P40050	688 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	HIS6	P40545	261 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	PEX8	P53248	589 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	EKI1	Q03764	534 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	COQ9	Q05779	260 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CRN1	Q06440	651 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CUR1	Q06469	252 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	PAH1	P32567	862 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	COT1	P32798	439 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	NUP120	P35729	1037 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YBR138C	P38277	524 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	VID30	P53076	958 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RTT102	P53330	157 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MET14	Q02196	202 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MLC2	Q06580	163 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	IES4	Q08561	116 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MED1	Q12321	566 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	PMS1	P14242	873 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SNA3	P14359	133 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CLB4	P24871	460 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RPC25	P35718	212 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	EXO84	P38261	753 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CTM1	P38818	585 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SPT8	P38915	602 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	LCB2	P40970	561 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	IAH1	P41734	238 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YNL146W	P53906	100 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RSF1	Q05043	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	COG4	Q06096	861 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RTP1	Q12751	981 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MSS18	P08593	268 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SPO16	P17122	198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	PHO13	P19881	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RPB8	P20436	146 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	UIP5	P36137	443 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YBR139W	P38109	508 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RIM2	P38127	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	PUG1	P40100	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	RTS2	P40962	232 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YTP1	P53584	459 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	VPS75	P53853	264 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	VPS72	Q03388	795 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	HIF1	Q12373	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	GAL1	P04385	528 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	DPH2	P32461	534 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	YOX1	P34161	385 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	SDS24	P38314	527 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	AZF1	P41696	914 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	CTK2	P46962	323 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	TIM8	P57744	87 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SLX1	YBR228W	DON1	Q05610	365 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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