RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC3AQ02505 3323 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC37A2A6NM11 1700 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 NMT2O60551 498 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CTDSPL2Q05D32 466 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 AAK1Q2M2I8 961 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP28Q4G0W2 176 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM67Q5HYA8 995 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR11Q9BZH6 1224 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTPP1Q9H773 170 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ERC2O15083 957 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ICAM1P05362 532 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TFF2Q03403 129 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CERS4Q9HA82 394 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPDC1A2A3K4 754 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CA3P07451 260 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTN1P12814 892 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CPT1AP50416 773 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6J1Q8NGC5 347 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 INCENPQ9NQS7 918 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RFXAPO00287 272 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A2P36021 539 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MORC4Q8TE76 937 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 IL17RBQ9NRM6 502 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PURAQ00577 322 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF4Q8WV16 495 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 VWCEQ96DN2 955 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC41PQ6P2S7 1318 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.761e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 TOMM22Q9NS69 142 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD50Q92878 1312 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NFIBO00712 420 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CALML3P27482 149 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNQ1P51787 676 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SYDE2Q5VT97 1194 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 TTBK2Q6IQ55 1244 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RETREG2Q8NC44 543 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GBF1Q92538 1859 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP1P13497 986 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF20Q3BBV1 942 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM122AQ96E09 287 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A7Q96T83 725 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP4BP1P59074 171 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE4DQ08499 809 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R5BQ15173 497 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC30A10Q6XR72 485 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 ARNTL2Q8WYA1 636 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 GPCPD1Q9NPB8 672 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 NOD1Q9Y239 953 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 MTCH2Q9Y6C9 303 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RFC2P35250 354 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PI4K2BQ8TCG2 481 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G5P39877 138 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF28PB7ZC32 967 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF207Q6ZRF8 634 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CHD7Q9P2D1 2997 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 EPOPA6NHQ4 379 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXP2O15409 715 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 BFSP2Q13515 415 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT40Q6A162 431 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 BTNL9Q6UXG8 535 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 COPS5Q92905 334 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 KPNA6O60684 536 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCF3P0C7M6 154 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TOP1P11387 765 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS53Q5VIR6 699 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 NFRKBQ6P4R8 1299 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 HERC6Q8IVU3 1022 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 SCFD2Q8WU76 684 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 COG5Q9UP83 839 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PITPNM1O00562 1244 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ORC4O43929 436 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TAP1Q03518 808 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM47Q9BQJ4 181 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC4Q9UJX5 808 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNP10599 105 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MX1P20591 662 aa32.21■■■□□ 2.75
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