RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 RNF146Q9NTX7 359 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 RIPK3Q9Y572 518 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 LCTP09848 1927 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SMCO2A6NFE2 343 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 COPB2P35606 906 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ADCY7P51828 1080 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 NLRP5P59047 1200 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 GUCY1B3Q02153 619 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CHST13Q8NET6 341 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PORCNQ9H237 461 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ACAD9Q9H845 621 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 EFCC1Q9HA90 598 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.79□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 H3BQV1 296 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 NFIBO00712 420 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 OPLAHO14841 1288 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CFBP00751 764 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PDCP20941 246 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 IFFO2Q5TF58 517 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 KRT40Q6A162 431 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 NSMFQ6X4W1 530 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CUL5Q93034 780 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MROH8Q9H579 483 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf50Q9HD87 102 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO40Q9UH90 709 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TSKSQ9UJT2 592 aa9.78□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ESYT2A0FGR8 921 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 MMP1P03956 469 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 SYT1P21579 422 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 CALML3P27482 149 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GNA11P29992 359 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 MAPK4P31152 587 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 KRT2P35908 639 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 SP3Q02447 781 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD2Q14681 263 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2SQ16763 222 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GPR142Q7Z601 462 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 BICD2Q8TD16 824 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D5Q92609 795 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 MMP19Q99542 508 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 WBP1LQ9NX94 342 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.77□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GPR25O00155 361 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 MEIS2O14770 477 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTS3O15072 1205 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 STX6O43752 255 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 POLR2MP0CAP2 368 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 FCER1AP12319 257 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 FCGRTP55899 365 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 KIF22Q14807 665 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 MCTP1Q6DN14 999 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GALNT17Q6IS24 598 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 BLIDQ8IZY5 108 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 RGS22Q8NE09 1264 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM260Q9NX78 707 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 PFASO15067 1338 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms