RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 EFCC1Q9HA90 598 aa24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.99■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.99■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.99■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 CHST13Q8NET6 341 aa23.99■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.99■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 SLC25A27O95847 323 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 CFBP00751 764 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 PGBD1Q96JS3 809 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 ACAD9Q9H845 621 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 RNF186Q9NXI6 227 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 WNT7AO00755 349 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 PLXNB2O15031 1838 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 ALDH1A1P00352 501 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.97■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 POLR2MP0CAP2 368 aa23.96■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 BICD2Q8TD16 824 aa23.96■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.96■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.96■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 TBC1D8O95759 1140 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 CTGFP29279 349 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 NSMFQ6X4W1 530 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 MROH8Q9H579 483 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.95■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 ASTN1O14525 1302 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 COPB2P35606 906 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 CAP1Q01518 475 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 BRAPQ7Z569 592 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO40Q9UH90 709 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 TCHHQ07283 1943 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 MGAMO43451 1857 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 RPTORQ8N122 1335 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 TRPA1O75762 1119 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 CCNA1P78396 465 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FGD4Q96M96 766 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 ANO3Q9BYT9 981 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 MAF1Q9H063 256 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.93■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 CNTN2Q02246 1040 aa23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 AP3B2Q13367 1082 aa23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 INF2Q27J81 1249 aa23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.91■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 NBR1Q14596 966 aa23.91■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.91■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 TBCKQ8TEA7 893 aa23.91■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 GPR142Q7Z601 462 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 IL31RAQ8NI17 732 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 MMP19Q99542 508 aa23.9■■□□□ 1.42
CSAG3-202ENST00000617158 PGK2P07205 417 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 PTPREP23469 700 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 MAPK4P31152 587 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 SREBF1P36956 1147 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 USP28Q96RU2 1077 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG3-202ENST00000617158 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms