RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1W2PQ27	194 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1W2PQ64	194 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1W2PQD8	194 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	TDP2	O95551	362 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	CMA1	P23946	247 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	CYTH3	O43739	400 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF75D	P51815	510 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	FANCC	Q00597	558 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	ICA1	Q05084	483 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	CUL4B	Q13620	913 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D5	Q92609	795 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	CUTA	O60888	179 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	GABPA	Q06546	454 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	POSTN	Q15063	836 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	PDHB	P11177	359 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	C6orf50	Q9HD87	102 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	GINS2	Q9Y248	185 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CTCFL-222	ENST00000609232	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP6R2	O75170	966 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	NID2	Q14112	1375 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPA	Q15257	358 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	TEX33	O43247	280 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	USP8	P40818	1118 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	RASSF7	Q02833	373 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65	9e-8	■■□□□ 14.3
CTCFL-222	ENST00000609232	MTF1	Q14872	753 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	ACER1	Q8TDN7	264 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	GNA11	P29992	359 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	TNIP1	Q15025	636 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A087X0B3	334 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	ENTPD3	O75355	529 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	EGFR	P00533	1210 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	ALAS1	P13196	640 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	GNG11	P61952	73 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	POTED	Q86YR6	584 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	KSR1	Q8IVT5	923 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	EPS15	P42566	896 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE4D	Q08499	809 aa		11	□□□□□ -0.65
CTCFL-222	ENST00000609232	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11	□□□□□ -0.65	2e-9	■□□□□ 9.2

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