RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 RASEFQ8IZ41 740 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 TMTC2Q8N394 836 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 NEK1Q96PY6 1258 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 PIGSQ96S52 555 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 RIOX1Q9H6W3 641 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 SPC25Q9HBM1 224 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 VTA1Q9NP79 307 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa35.7■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 CYTH3O43739 400 aa35.7■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 PDE4DQ08499 809 aa35.7■■■■□ 3.31
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CMTM4-204ENST00000563952 TAPT1Q6NXT6 567 aa35.7■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 KLHDC9Q8NEP7 349 aa35.7■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 DNERQ8NFT8 737 aa35.7■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CMTM4-204ENST00000563952 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa35.7■■■■□ 3.31
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CMTM4-204ENST00000563952 A0A1W2PQY0 241 aa35.69■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 KIF5BP33176 963 aa35.69■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 LIFRP42702 1097 aa35.69■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 GJA9P57773 515 aa35.69■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 KCNA10Q16322 511 aa35.69■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 PIBF1Q8WXW3 757 aa35.69■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 MAP3K14Q99558 947 aa35.69■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 SMPD1P17405 629 aa35.68■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 ACLYP53396 1101 aa35.68■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 ADCK5Q3MIX3 580 aa35.68■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 IQSEC1Q6DN90 963 aa35.68■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 MAF1Q9H063 256 aa35.68■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 CFBP00751 764 aa35.67■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 TRIM60Q495X7 471 aa35.67■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 GNASQ5JWF2 1037 aa35.67■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 TLK2Q86UE8 772 aa35.67■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa35.67■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 COL20A1Q9P218 1284 aa35.67■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 SLC12A7Q9Y666 1083 aa35.67■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 B4DLN1 442 aa35.66■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 TSGA10IPQ3SY00 556 aa35.66■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 TCEANC2Q96MN5 208 aa35.66■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 TAAR1Q96RJ0 339 aa35.66■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 TMEM63BQ5T3F8 832 aa35.65■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 AP5M1Q9H0R1 490 aa35.65■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 OPLAHO14841 1288 aa35.64■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 CALM2P0DP24 149 aa35.64■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 CALM3P0DP25 149 aa35.64■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 EDNRBP24530 442 aa35.64■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 TRAF1Q13077 416 aa35.64■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
CMTM4-204ENST00000563952 STARD7Q9NQZ5 370 aa35.64■■■■□ 3.3
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CMTM4-204ENST00000563952 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 RMDN3Q96TC7 470 aa35.63■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 WDR11Q9BZH6 1224 aa35.63■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 DNAH12Q6ZR08 3092 aa35.63■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 CTAGE5O15320 804 aa35.62■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 PLEKHA8P1O95397 391 aa35.62■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 GNAQP50148 359 aa35.62■■■■□ 3.29
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CMTM4-204ENST00000563952 SPZ1Q9BXG8 430 aa35.62■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 PRO3102Q9H379 93 aa35.62■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa35.62■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 HSPA4P34932 840 aa35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 HSD17B4P51659 736 aa35.61■■■■□ 3.29
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CMTM4-204ENST00000563952 C1orf53Q5VUE5 145 aa35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGEF16Q5VV41 709 aa35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 SGMS1Q86VZ5 419 aa35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 MICU3Q86XE3 530 aa35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 VTI1AQ96AJ9 217 aa35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CMTM4-204ENST00000563952 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
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