RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM7Q9C029 511 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 STAP2Q9UGK3 403 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 SPG7Q9UQ90 795 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 IPPQ9Y573 584 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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CAPN3-211ENST00000562199 NEK1Q96PY6 1258 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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CAPN3-211ENST00000562199 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.25□□□□□ -1.41
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CAPN3-211ENST00000562199 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.24□□□□□ -1.41
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