RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 AMNQ9BXJ7 453 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 MAF1Q9H063 256 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PRO3102Q9H379 93 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 VTA1Q9NP79 307 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 EDNRBP24530 442 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 LIFRP42702 1097 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 GJA9P57773 515 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 DNERQ8NFT8 737 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 FERMT2Q96AC1 680 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PIGSQ96S52 555 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 COL20A1Q9P218 1284 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 A0A1W2PQY0 241 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 CTAGE5O15320 804 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PTGS1P23219 599 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 RTP1P59025 263 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 NKX3-2P78367 333 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 GHRHRQ02643 423 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TNFAIP2Q03169 654 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 HOMER1Q86YM7 354 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 KCNB2Q92953 911 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 NEK1Q96PY6 1258 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 CCDC69A6NI79 296 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 SMPD1P17405 629 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 SYN1P17600 705 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TMTC2Q8N394 836 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 RXRAP19793 462 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 ACLYP53396 1101 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 KCNA10Q16322 511 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 KIF5BP33176 963 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 HSPA4P34932 840 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 HSD17B4P51659 736 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 KRT32Q14532 448 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TRIM60Q495X7 471 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TLK2Q86UE8 772 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-219ENST00000550655 PDE4DQ08499 809 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 GDF15Q99988 308 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 SPC25Q9HBM1 224 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 REC8O95072 547 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 CFBP00751 764 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 ASGR1P07306 291 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 CALM1P0DP23 149 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 CALM2P0DP24 149 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 CALM3P0DP25 149 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 SMARCA1P28370 1054 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 BEX3Q00994 111 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 Q9Y3F1 56 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 TRAF1Q13077 416 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 GNASQ5JWF2 1037 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 APOA5Q6Q788 366 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 MICU3Q86XE3 530 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 RMDN3Q96TC7 470 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-219ENST00000550655 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms