RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 MEIS2O14770 477 aa23.4■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 MAPK4P31152 587 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 HSD17B4P51659 736 aa23.4■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 WDR78Q5VTH9 848 aa23.4■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 TBC1D5Q92609 795 aa23.4■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 EFCC1Q9HA90 598 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.4■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 M0R2N6 131 aa23.39■■□□□ 1.33
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TSTA3-215ENST00000532308 UBE2SQ16763 222 aa23.39■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.39■■□□□ 1.33
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TSTA3-215ENST00000532308 STRNO43815 780 aa23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 F13A1P00488 732 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSTA3-215ENST00000532308 NR5A1Q13285 461 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSTA3-215ENST00000532308 BRAPQ7Z569 592 aa23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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TSTA3-215ENST00000532308 FERMT3Q86UX7 667 aa23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 TNFRSF25Q93038 417 aa23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.37■■□□□ 1.33
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TSTA3-215ENST00000532308 SP3Q02447 781 aa23.34■■□□□ 1.33
TSTA3-215ENST00000532308 KIF22Q14807 665 aa23.34■■□□□ 1.33
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TSTA3-215ENST00000532308 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.32■■□□□ 1.32
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TSTA3-215ENST00000532308 COL20A1Q9P218 1284 aa23.32■■□□□ 1.32
TSTA3-215ENST00000532308 GPR25O00155 361 aa23.31■■□□□ 1.32
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TSTA3-215ENST00000532308 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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TSTA3-215ENST00000532308 LCTP09848 1927 aa23.3■■□□□ 1.32
TSTA3-215ENST00000532308 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.3■■□□□ 1.32
TSTA3-215ENST00000532308 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TSTA3-215ENST00000532308 ADORA2AP29274 412 aa23.3■■□□□ 1.32
TSTA3-215ENST00000532308 SREBF1P36956 1147 aa23.3■■□□□ 1.32
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