RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 THBDP07204 575 aa6.71□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 ATP2B1P20020 1258 aa6.71□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 GLDCP23378 1020 aa6.71□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 KCNJ6P48051 423 aa6.71□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 LZTR1Q8N653 840 aa6.69□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.68□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 CYBBP04839 570 aa6.68□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 MED14OSP0DP75 135 aa6.68□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 EPHB3P54753 998 aa6.68□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 NR1I3Q14994 352 aa6.68□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.68□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 GCM1Q9NP62 436 aa6.68□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 CD320Q9NPF0 282 aa6.68□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.67□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.66□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.66□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 IRAK3Q9Y616 596 aa6.66□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 A0A1W2PQU0 124 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 N4BP3O15049 544 aa6.65□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 PRR5P85299 388 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.65□□□□□ -1.34
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CPEB4-210ENST00000522344 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 MZB1Q8WU39 189 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC140Q96MF4 163 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 MTA3Q9BTC8 594 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.65□□□□□ -1.34
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD3Q9Y597 815 aa6.65□□□□□ -1.34
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