RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 PNMA1Q8ND90 353 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 MOB2Q70IA6 237 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC102AQ96A19 550 aa8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.07□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.06□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.06□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.06□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.06□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 CSADQ9Y600 493 aa8.06□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 A0A087WWV3 80 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 AIFM3Q96NN9 605 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 TRAF5O00463 557 aa8.05□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 TXLNAP40222 546 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 SPP2Q13103 211 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 BRD3Q15059 726 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.05□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 OTUD5Q96G74 571 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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ROBO1-211ENST00000498428 ENO4A6NNW6 628 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 EBAG9O00559 213 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 KIF5BP33176 963 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 GSDMDP57764 484 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 NLRP5P59047 1200 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.05□□□□□ -1.12
ROBO1-211ENST00000498428 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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