RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 CALML3P27482 149 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-217ENST00000496298 CDK7P50613 346 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-217ENST00000496298 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-217ENST00000496298 USH1GQ495M9 461 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-217ENST00000496298 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-217ENST00000496298 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 GPR153Q6NV75 609 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP40-217ENST00000496298 BEX3Q00994 111 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-217ENST00000496298 TROAPQ12815 778 aa22.6■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.6■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 PDE4DQ08499 809 aa22.58■■□□□ 1.21
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USP40-217ENST00000496298 SKAP1Q86WV1 359 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.57■■□□□ 1.2
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USP40-217ENST00000496298 COL20A1Q9P218 1284 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 TBX21Q9UL17 535 aa22.57■■□□□ 1.2
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USP40-217ENST00000496298 ZEB2O60315 1214 aa22.56■■□□□ 1.2
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USP40-217ENST00000496298 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.56■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 IWS1Q96ST2 819 aa22.56■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 MAP3K14Q99558 947 aa22.56■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 SLC27A2O14975 620 aa22.55■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 HSD17B4P51659 736 aa22.55■■□□□ 1.2
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USP40-217ENST00000496298 SCFD2Q8WU76 684 aa22.55■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 LY9Q9HBG7 655 aa22.55■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 GRIN2DO15399 1336 aa22.55■■□□□ 1.2
USP40-217ENST00000496298 CYTH3O43739 400 aa22.54■■□□□ 1.2
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