RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489783.1

SHOC2-206, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, humanhuman

TSL 2

Gene SHOC2, Length 749 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2-206ENST00000489783 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.6■■□□□ 1.85
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SHOC2-206ENST00000489783 GJD3Q8N144 294 aa26.58■■□□□ 1.85
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SHOC2-206ENST00000489783 FAM160B2Q86V87 743 aa26.57■■□□□ 1.84
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SHOC2-206ENST00000489783 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.57■■□□□ 1.84
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SHOC2-206ENST00000489783 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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SHOC2-206ENST00000489783 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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SHOC2-206ENST00000489783 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.53■■□□□ 1.84
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SHOC2-206ENST00000489783 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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SHOC2-206ENST00000489783 WDFY4Q6ZS81 3184 aa26.46■■□□□ 1.83
SHOC2-206ENST00000489783 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.46■■□□□ 1.83
SHOC2-206ENST00000489783 M0R2C6 588 aa26.46■■□□□ 1.83
SHOC2-206ENST00000489783 NFIBO00712 420 aa26.46■■□□□ 1.83
SHOC2-206ENST00000489783 KPNA6O60684 536 aa26.46■■□□□ 1.83
SHOC2-206ENST00000489783 ICAM1P05362 532 aa26.46■■□□□ 1.83
SHOC2-206ENST00000489783 CHMP4BP1P59074 171 aa26.46■■□□□ 1.83
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