RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 TP53INP1Q96A56 240 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR39O43194 453 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 F13BP05160 661 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CLCN7P51798 805 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 RTP2Q5QGT7 225 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF43Q68DV7 783 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF18BQ86Y91 864 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC103Q8IW40 242 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL6Q8N531 539 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 DIO2Q92813 273 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 USP7Q93009 1102 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 WNK4Q96J92 1243 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC1Q99614 292 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ALG1Q9BT22 464 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC1BQ9P126 229 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CEACAM5P06731 702 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SYPP08247 313 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 GSTM1P09488 218 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 BPIP17213 487 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNA6P17658 529 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 PAMP19021 973 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 STAT4Q14765 748 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 LBX2Q6XYB7 198 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SHISA5Q8N114 240 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP19Q99542 508 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 IFT22Q9H7X7 185 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 TCFL5Q9UL49 500 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 U3KQE9 123 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 H3BS24 57 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CBX4O00257 560 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ARNTLO00327 626 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ZEB2O60315 1214 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 MSCO60682 206 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ALDH1L1O75891 902 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 GATA4P43694 442 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SCNN1BP51168 640 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 NFIAQ12857 509 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 PAK1Q13153 545 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 KIZQ2M2Z5 673 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 GAB4Q2WGN9 574 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP13Q9UII6 198 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 KATNA1O75449 491 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 LCP1P13796 627 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 EPHB1P54762 984 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 ATG3Q9NT62 314 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 EID1Q9Y6B2 187 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 WNT9AO14904 365 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 GSC2O15499 205 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 MYO1BO43795 1136 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 F2P00734 622 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 CKMP06732 381 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 LTKP29376 864 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-207ENST00000470201 TMPRSS15P98073 1019 aa6.29□□□□□ -1.4
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