RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SPDYE3A6NKU9 549 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R2N6 131 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NFIBO00712 420 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 MEIS2O14770 477 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 OPLAHO14841 1288 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 STRNO43815 780 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PEX10O60683 326 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPA1O75762 1119 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 F13A1P00488 732 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 FCER1AP12319 257 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 KCTD2Q14681 263 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR78Q5VTH9 848 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 USP17L6PQ6QN14 398 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NSMFQ6X4W1 530 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF207Q6ZRF8 634 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHA6Q9UN73 950 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0G2JMZ2 1700 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D8O95759 1140 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS6P62753 249 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 RESTQ13127 1097 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NR5A1Q13285 461 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PKP1Q13835 747 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF22Q14807 665 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2SQ16763 222 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 FERMT3Q86UX7 667 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 OXER1Q8TDS5 423 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D5Q92609 795 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP19Q99542 508 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PORCNQ9H237 461 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 EFCC1Q9HA90 598 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF28PB7ZC32 967 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 POTEB2H3BUK9 544 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAPPC10P48553 1259 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR142Q7Z601 462 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 FCHSD1Q86WN1 690 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 DNERQ8NFT8 737 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 RASGRP4Q8TDF6 673 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF25Q93038 417 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ANO3Q9BYT9 981 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM260Q9NX78 707 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC5A4Q9NY91 659 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 B4DLN1 442 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPREP23469 700 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 FCGRTP55899 365 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SP3Q02447 781 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF6Q15052 776 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 RILPL1Q5EBL4 403 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF16Q5VV41 709 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ATL3Q6DD88 541 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC30A10Q6XR72 485 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 RMDN3Q96TC7 470 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SMCHD1A6NHR9 2005 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR25O00155 361 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS3O15072 1205 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ADORA2AP29274 412 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SREBF1P36956 1147 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 USP11P51784 963 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 GRB14Q14449 540 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 INF2Q27J81 1249 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 NEK8Q86SG6 692 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 DPP9Q86TI2 863 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 TBCKQ8TEA7 893 aa10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms