RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PNMA2Q9UL42 364 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 REV3LO60673 3130 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 GBF1Q92538 1859 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 ZBBXA8MT70 800 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 ALAS1P13196 640 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CPT1AP50416 773 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CNTN2Q02246 1040 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 TTC22Q5TAA0 569 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 SKAP1Q86WV1 359 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 RFC2P35250 354 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 TFAP4Q01664 338 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 PPARAQ07869 468 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 STX8Q9UNK0 236 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 TSPY2A6NKD2 308 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 B4DLN1 442 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 KIF28PB7ZC32 967 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 HIP1O00291 1037 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 B4GALT4O60513 344 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 SMPD1P17405 629 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 PTGS1P23219 599 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CCL23P55773 120 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 RCSD1Q6JBY9 416 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 AGBL1Q96MI9 1066 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 SLC9A7Q96T83 725 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 TOMM22Q9NS69 142 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 ASTN1O14525 1302 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 KPNA6O60684 536 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 MYOGP15173 224 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 PLA2G5P39877 138 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 RABGGTBP53611 331 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 NSMFQ6X4W1 530 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 FAM122AQ96E09 287 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 TRPV6Q9H1D0 765 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 COG5Q9UP83 839 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-210ENST00000442481 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 ZNF536O15090 1300 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 GRIN2DO15399 1336 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 TNKSO95271 1327 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 FOXP2O15409 715 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 ICAM1P05362 532 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 MCCP23508 829 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 HAND2P61296 217 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 RETREG2Q8NC44 543 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 MORC4Q8TE76 937 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 DCAF4Q8WV16 495 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 VWCEQ96DN2 955 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 WNT8AQ9H1J5 351 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 PRR12Q9ULL5 1215 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 TRANK1O15050 2925 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 PITPNM1O00562 1244 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 BMP1P13497 986 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 TFF2Q03403 129 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 BFSP2Q13515 415 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 CCDC96Q2M329 555 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 KCTD1Q719H9 257 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 EEPD1Q7L9B9 569 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 TICAM2Q86XR7 235 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 CCDC155Q8N6L0 562 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 WDR11Q9BZH6 1224 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 NOD1Q9Y239 953 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PRAME-210ENST00000442481 FGAP02671 866 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms