RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXK1P85037 733 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MFSD10Q14728 455 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FANCBQ8NB91 859 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYLIPQ8WY64 445 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHKBQ93100 1093 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP7D2Q96T17 732 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLIC4Q9Y696 253 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GVL5 298 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCP110O43303 1012 aa7.18□□□□□ -1.26
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SHQ1P1-201ENST00000437111 DTNBO60941 627 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF202O95125 648 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 HMGCRP04035 888 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL6A1P12109 1028 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 RXRAP19793 462 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFA8P51970 172 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRP12P59046 1061 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NTRK3Q16288 839 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SBK1Q52WX2 424 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 RESP18Q5W5W9 173 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLPP6Q8IY26 295 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPC24Q8NBT2 197 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 COA7Q96BR5 231 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSPY2A6NKD2 308 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF28PB7ZC32 967 aa7.17□□□□□ -1.26
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SHQ1P1-201ENST00000437111 DYNC1I1O14576 645 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 IKBKBO14920 756 aa7.17□□□□□ -1.26
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SHQ1P1-201ENST00000437111 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGRP09769 529 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CALML3P27482 149 aa7.17□□□□□ -1.26
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SHQ1P1-201ENST00000437111 GNAQP50148 359 aa7.17□□□□□ -1.26
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SHQ1P1-201ENST00000437111 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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SHQ1P1-201ENST00000437111 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNNM3Q8NE01 707 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEKT1Q969V4 418 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FERMT2Q96AC1 680 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP3K14Q99558 947 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 KAT14Q9H8E8 782 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM75PA6NK02 468 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMC2O95347 1197 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 UQCRHP07919 91 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOSL2P15408 326 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TXLNAP40222 546 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAPPC10P48553 1259 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYL5Q02045 173 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 IQCB1Q15051 598 aa7.17□□□□□ -1.26
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