RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SMIM25-201ENST00000421019 ORC4O43929 436 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 NMT2O60551 498 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PTGS1P23219 599 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 NOVP48745 357 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 CPT1AP50416 773 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RABGGTBP53611 331 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 CTDSPL2Q05D32 466 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 BTNL9Q6UXG8 535 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 SCLYQ96I15 445 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 ANAPC4Q9UJX5 808 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MTMR7Q9Y216 660 aa12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TNKSO95271 1327 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 KPNA6O60684 536 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 ACTN1P12814 892 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PURAQ00577 322 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 ALX1Q15699 326 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 AAK1Q2M2I8 961 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM67Q5HYA8 995 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM63BQ5T3F8 832 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 SYDE2Q5VT97 1194 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 INCENPQ9NQS7 918 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 CDH23Q9H251 3354 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RAD50Q92878 1312 aa12.88□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 EYSQ5T1H1 3165 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PTPDC1A2A3K4 754 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 B4DLN1 442 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 FOXP2O15409 715 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MYL3P08590 195 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 FGRP09769 529 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TOP1P11387 765 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 CYP2C9P11712 490 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MYOGP15173 224 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MX1P20591 662 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RFC2P35250 354 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 SLC16A2P36021 539 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TTLL4Q14679 1199 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RETREG2Q8NC44 543 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 VWCEQ96DN2 955 aa12.87□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 NFIBO00712 420 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 NEFLP07196 543 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PDE4DQ08499 809 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PPP2R5BQ15173 497 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 NBPF20Q3BBV1 942 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 FAM47CQ5HY64 1035 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 NFRKBQ6P4R8 1299 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RNF207Q6ZRF8 634 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RASGRP2Q7LDG7 609 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 DEFB128Q7Z7B8 93 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 MICALL1Q8N3F8 863 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 OR6J1Q8NGC5 347 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 SCFD2Q8WU76 684 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 EVI5LQ96CN4 794 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 SLC9A7Q96T83 725 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 HELLSQ9NRZ9 838 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TOMM22Q9NS69 142 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 A6NJR5 290 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 KIF28PB7ZC32 967 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 PITPNM1O00562 1244 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 BMP1P13497 986 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 CALML3P27482 149 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 BFSP2Q13515 415 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 DNERQ8NFT8 737 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TTC14Q96N46 770 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM47Q9BQJ4 181 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 GPCPD1Q9NPB8 672 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 BDP1A6H8Y1 2624 aa12.85□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 CA3P07451 260 aa12.84□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 IQCF3P0C7M6 154 aa12.84□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 EDNRBP24530 442 aa12.84□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 VPS53Q5VIR6 699 aa12.84□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 TICAM2Q86XR7 235 aa12.84□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.84□□□□□ -0.35
SMIM25-201ENST00000421019 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms