RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 LAPTM4AQ15012 233 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 DPH6Q7L8W6 267 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TMC7Q7Z402 723 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 MKNK1Q9BUB5 465 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 SLC15A5A6NIM6 579 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 DNM1LO00429 736 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 BCAR3O75815 825 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 PGK1P00558 417 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 PGK2P07205 417 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 CYP2D6P10635 497 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 ITGB8P26012 769 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 EPHB4P54760 987 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 GRB14Q14449 540 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 SEPT2Q15019 361 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TNNI3KQ59H18 835 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 BAP1Q92560 729 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 LPAR1Q92633 364 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.78□□□□□ -1.48
TMLHE-202ENST00000369439 EYSQ5T1H1 3165 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 SORBS3O60504 671 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 COBLO75128 1261 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 GNAI2P04899 355 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 GNAI3P08754 354 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 RAG1P15918 1043 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 CAPN2P17655 700 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 IGFBP4P22692 258 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 TLE2Q04725 743 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 MTMR3Q13615 1198 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 GRIN2CQ14957 1233 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC41Q15345 812 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 RNF34Q969K3 372 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 ATG4CQ96DT6 458 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 TINF2Q9BSI4 451 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 CABP5Q9NP86 173 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 149.1
TMLHE-202ENST00000369439 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 MYH1P12882 1939 aa5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 FOCADQ5VW36 1801 aa5.76□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 CDH23Q9H251 3354 aa5.76□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 A0A1W2PRG0 241 aa5.76□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.76□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 SMIM22K7EJ46 135 aa5.76□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 MSCO60682 206 aa5.76□□□□□ -1.49
TMLHE-202ENST00000369439 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms