RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.72■■□□□ 1.23
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 VTA1Q9NP79 307 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNERQ8NFT8 737 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRCAP-201ENST00000326294 COL20A1Q9P218 1284 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GHRHRQ02643 423 aa22.7■■□□□ 1.22
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PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 FERMT2Q96AC1 680 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX17Q15036 470 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PQY0 241 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE5O15320 804 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALM1P0DP23 149 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALM2P0DP24 149 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALM3P0DP25 149 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMPD1P17405 629 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGS1P23219 599 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTP1P59025 263 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX3-2P78367 333 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE4DQ08499 809 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOA5Q6Q788 366 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MICU3Q86XE3 530 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFBP00751 764 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPA1P15085 419 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYN1P17600 705 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNAQP50148 359 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNA10Q16322 511 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLK2Q86UE8 772 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPC25Q9HBM1 224 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM60Q495X7 471 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RMDN3Q96TC7 470 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRO3102Q9H379 93 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTBP2Q14767 1821 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 BEX3Q00994 111 aa22.64■■□□□ 1.21
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