RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 SRGAP2O75044 1071 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 GYS2P54840 703 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CYP27A1Q02318 531 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 DDR1Q08345 913 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 TRIM14Q14142 442 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CALCRLQ16602 461 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.52■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MYH8P13535 1937 aa21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 IDEP14735 1019 aa21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 EDIL3O43854 480 aa21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.51■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SBF2Q86WG5 1849 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 PLCG2P16885 1265 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 HERVK_113P62684 666 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 LRRC41Q15345 812 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 KCTD1Q719H9 257 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CALML4Q96GE6 196 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 AK8Q96MA6 479 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC66A2RUB6 948 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 RCCD1A6NED2 376 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MYMKA6NI61 221 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CCNE1P24864 410 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 GRB10Q13322 594 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CERS5Q8N5B7 392 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.5■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 FAM196BA6NMK8 535 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 KCNK18Q7Z418 384 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 DNAJC7Q99615 494 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SRGNP10124 158 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 DNM2P50570 870 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 ADCY7P51828 1080 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CACNB3P54284 484 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CEP112Q8N8E3 955 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 FUT8Q9BYC5 575 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.49■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MIIPQ5JXC2 388 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CERKQ8TCT0 537 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 PNMA5Q96PV4 448 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MYL1P05976 194 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 FAM193AP78312 1265 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SV2BQ7L1I2 683 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 KIAA1328Q86T90 577 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MYO6Q9UM54 1294 aa21.48■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 GAKO14976 1311 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 A0A1W2PQC6 194 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 EPHB6O15197 1021 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 BBOX1O75936 387 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 ECM1Q16610 540 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MTMR9Q96QG7 549 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 USP40Q9NVE5 1235 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC96Q2M329 555 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 HINFPQ9BQA5 517 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.47■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CTAGE8P0CG41 777 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 NFIAQ12857 509 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 CUEDC2Q9H467 287 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.46■■□□□ 1.03
NHLH2-201ENST00000320238 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms