RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000103059.1

Col9a3-201, Transcript of Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col9a3, Length 2,846 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Phldb2Q8K1N2 1249 aa14.72□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa14.72□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Exoc1Q8R3S6 894 aa14.72□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mss51Q9D5Z5 446 aa14.72□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Slc5a4aQ9ET37 656 aa14.72□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Chd5A2A8L1 1946 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Dnajc21E9Q8D0 531 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 EgfrQ01279 1210 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Chrna5Q2MKA5 467 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Eme2Q56A04 373 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 PRAG1Q571I4 1179 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Islr2Q5RKR3 745 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Grm4Q68EF4 912 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Erlin2Q8BFZ9 340 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Trim6Q8BGE7 488 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Vipas39Q8BGQ1 491 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Xrcc4Q924T3 326 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 NapgQ9CWZ7 312 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 ToporslQ9D2F8 683 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Znf287Q9EQB9 759 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cntnap1O54991 1385 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gm5934D3Z4U6 212 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Copb2O55029 905 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Lilrb3P97484 841 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tnni3kQ5GIG6 834 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tsr1Q5SWD9 803 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cnnm4Q69ZF7 771 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Fam196bQ6GQV1 535 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tmem63cQ8CBX0 802 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 TbcbQ9D1E6 244 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa14.71□□□□□ -0.05
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ankrd35E9Q9D8 996 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Sap30bpQ02614 308 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Map3k12Q60700 888 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Prpf40bQ80W14 870 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Q8C5C9 218 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ccdc14Q8K2J4 934 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Arl6ip4Q9JM93 229 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Frmpd4A2AFR3 1320 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ecm29Q6PDI5 1840 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ctdp1Q7TSG2 960 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Bbs9Q811G0 885 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mtmr4Q91XS1 1190 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Git2Q9JLQ2 708 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Speer4f2E9Q366 295 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 NpcdF8VQB8 469 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Fdx1P46656 188 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Wee1P47810 646 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Foxn3Q499D0 457 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Calcoco1Q8CGU1 691 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Prl2c5Q9JLV9 222 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Abhd2Q9QXM0 425 aa14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Kif23E9Q5G3 953 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Chp1P61022 195 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ccdc33Q3ULW6 985 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Pim2Q62070 370 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mettl5Q8K1A0 209 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Znf131Q8K3J5 619 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tmem134Q8R0J4 195 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Klrc1Q9Z202 244 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Lrrc32G3XA59 663 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Folh1O35409 752 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Lca5Q80ST9 704 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ccdc172Q810N9 267 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Trim9Q8C7M3 817 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ccdc186Q8C9S4 917 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Onecut3Q8K557 490 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 MymkQ9D1N4 221 aa14.69□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ltbp2O08999 1813 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tpp1O89023 562 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cacnb3P54285 484 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Q32P12 615 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Kctd1Q5M956 257 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Jade2Q6ZQF7 829 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Spice1Q8C804 860 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ushbp1Q8R370 680 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Kctd10Q922M3 315 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gdf10P97737 476 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Krt86P97861 486 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Kcnb1Q03717 857 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tmed8Q3UHI4 326 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Clca4aQ6Q473 924 aa14.68□□□□□ -0.06
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Arhgef19Q8BWA8 802 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.7 ms