RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028948.4

Gins1-201, Transcript of DNA replication complex GINS protein PSF1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gins1, Length 1,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins1-201ENSMUST00000028948 Epha10Q8BYG9 1007 aa17.79■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tshz3Q8CGV9 1081 aa17.79■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tmc1Q8R4P5 757 aa17.79■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Lzts2Q91YU6 671 aa17.79■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Atp1a4Q9WV27 1032 aa17.79■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Dnajc25A2ALW5 357 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Trim12cD3Z3L3 497 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gm20503G3UZK1 150 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Mboat4P0C7A3 435 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Aco1P28271 889 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Fbln1Q08879 705 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 A1cfQ5YD48 595 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Elf1Q60775 612 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Fam109aQ8BH49 266 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Atf7Q8R0S1 413 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Lama3Q61789 3330 aa17.78■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rnf123Q5XPI3 1314 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Jakmip2D3YXK0 820 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ppef2O35385 757 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 GaaP70699 953 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gm21985Q6P6P5 1106 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gprc5cQ8K3J9 440 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Hdhd5Q91WM2 419 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Sppl3Q9CUS9 384 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Galk1Q9R0N0 392 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tle2Q9WVB2 767 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa17.77■□□□□ 0.44
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gon4lQ9DB00 2260 aa17.77■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Dnai2A2AC93 623 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 StrnO55106 780 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 NcanP55066 1268 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Eif3j2Q66JS6 263 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Galnt17Q7TT15 598 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Lrrc15Q80X72 579 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Agbl2Q8CDK2 862 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Onecut3Q8K557 490 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cnpy3Q9DAU1 276 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 PalmdQ9JHU2 551 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tmem191cQ9JJB1 302 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ncor1Q60974 2453 aa17.76■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Wdr19Q3UGF1 1341 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 EporP14753 507 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cd72P21855 354 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Pik3r1P26450 724 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cyp2e1Q05421 493 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 B4galnt3Q6L8S8 986 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Triml1Q8BVP1 470 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 DymQ8CHY3 669 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Kdm4bQ91VY5 1086 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tmem39aQ9CYC3 486 aa17.75■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Hoxa13Q62424 386 aa17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Rusc1Q8BG26 893 aa17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cdan1Q8CC12 1239 aa17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Etv3Q8R4Z4 513 aa17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Galntl5Q9D4M9 431 aa17.74■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Sbno2Q7TNB8 1349 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Metap2O08663 478 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Aldh1a1P24549 501 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Lman2lP59481 347 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gdf10P97737 476 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Jakmip3Q5DTN8 844 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Nacc1Q7TSZ8 514 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Phf24Q80TL4 400 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ncaph2Q8BSP2 607 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Tekt1Q9DAJ2 418 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Plod3Q9R0E1 741 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ttc6G3UYY4 1857 aa17.73■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Col5a3Q9JLI2 1739 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Me1P06801 572 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ptpn22P29352 802 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Fam189a2Q4FZH1 290 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Plcd1Q8R3B1 756 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cul5Q9D5V5 780 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Gpaa1Q9WTK3 621 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Arid3bQ9Z1N7 568 aa17.72■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Cops5O35864 334 aa17.71■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 SfnO70456 248 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Stra6O70491 670 aa17.71■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 PuraP42669 321 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Nlrx1Q3TL44 975 aa17.71■□□□□ 0.43
Gins1-201ENSMUST00000028948 Slc9a7Q8BLV3 726 aa17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.6 ms