RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YPS3Q12303 508 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RAV1P47104 1357 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MIH1P23748 554 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ECM15P35195 104 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A KKQ8P36004 724 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YPT10P38146 199 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A CDS1P38221 457 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RGI2P40188 164 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A DUG1P43616 481 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ATG23Q06671 453 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ARP7Q12406 477 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YOR019WQ99248 730 aa0.38□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A PEP1P32319 1579 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SPT15P13393 240 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ATP3P38077 311 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YGP1P38616 354 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SWD1P39706 426 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A DOT5P40553 215 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A DPB11P47027 764 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A IRC25Q07951 179 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MPD2Q99316 277 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A FRE1P32791 686 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A FLC3P53121 802 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RMD9P53140 646 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RRP46P53256 223 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MEP3P53390 489 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YNR071CP53757 342 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SAM50P53969 484 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A VMS1Q04311 632 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A PIG1Q06216 648 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YOL087CQ99247 1116 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SGS1P35187 1447 aa0.37□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MF(ALPHA)1P01149 165 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ADH4P10127 382 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A NDI1P32340 513 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A PTH2P34222 208 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A NTR2P36118 322 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A DUG2P38149 878 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ALG5P40350 334 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YIL060WP40519 144 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A HIS6P40545 261 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A BIR1P47134 954 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A BIO3P50277 480 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A VID30P53076 958 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YFL068WP0CX99 160 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YLL066W-AP0CY00 160 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YLL067W-AP0CY01 160 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SGV1P23293 657 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A POP5P28005 173 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A APE2P32454 952 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A PRS1P32895 427 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A CIN4P39110 191 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MGS1P40151 587 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A CTK2P46962 323 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A VEL1P53058 206 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MRPL13Q02204 264 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YLR001CQ07895 862 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SNX3Q08826 162 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A IML1P47170 1584 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SNF1P06782 633 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ATP12P22135 325 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YLF2P38746 405 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SSN8P47821 323 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YIP5P53108 310 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RBA50Q04418 439 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A INP53Q12271 1107 aa0.36□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A POL1P13382 1468 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A EST1P17214 699 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A IDH2P28241 369 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YHR131CP38835 850 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ECM10P39987 644 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YNL092WP53934 400 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A BET5Q03630 159 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A CAC2Q04199 468 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A DIC1Q06143 298 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A THP1Q08231 455 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A POM152P39685 1337 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SST2P11972 698 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A MAK32P23060 363 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A IMG1P25626 169 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A FMT1P32785 401 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A GPP1P41277 250 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A CWC22P53333 577 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YIF1P53845 314 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YML037CQ03703 340 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A YDR239CQ03780 787 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A IES4Q08561 116 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A ENT1Q12518 454 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A PUT3P25502 979 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A GAC1P28006 793 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A GPI18P38211 433 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A TMA108P40462 946 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A PKP1P40530 394 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A SPG5P42933 373 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A RMD8P43620 662 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A POL31P46957 487 aa0.35□□□□□ -2.35
YPL060C-AYPL060C-A BSC5P53755 489 aa0.35□□□□□ -2.35
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