RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PHO3P24031 467 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PEP3P27801 918 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W FRE1P32791 686 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YBR259WP38338 688 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W KEL2P50090 882 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NPY1P53164 384 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NOG2P53742 486 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YCR015CP25616 317 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PCL2P25693 308 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RPD3P32561 433 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YBL029WP38201 376 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CBR1P38626 284 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YHL012WP38709 493 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ZRG8P40021 1076 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YJL068CP40363 299 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YIL067CP40514 678 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W FIS1P40515 155 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PRM2P40534 656 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YIL001WP40560 513 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SSU1P41930 458 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W APS3P47064 194 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PUS2P53167 370 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W COG7P53195 279 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ATG33Q06485 197 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NDL1Q06568 189 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SMI1P32566 505 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W OPY1P38271 328 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W VHR1P40522 640 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YKU80Q04437 629 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HMG1P12683 1054 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W AMS1P22855 1083 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PLB1P39105 664 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ELO3P40319 345 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YIL092WP40497 633 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ATP25Q03153 612 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SRT1Q03175 343 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TIP41Q12199 356 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W APA1P16550 321 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SEC65P29478 273 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TMT1P32643 299 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HBS1P32769 611 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W STB6P36085 766 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YBR053CP38235 358 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TPA1P40032 644 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YIL165CP40446 119 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GNP1P48813 663 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HER2Q03557 464 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YDR109CQ04585 715 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W IRC13Q08630 104 aa2.84□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TY4B-HP0C2J7 1802 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PHO5P00635 467 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W DAP2P18962 818 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W EHT1P38295 451 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W STL1P39932 569 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W BUD8P41698 603 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ORC3P54790 616 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RSA1Q08932 381 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SEY1Q99287 776 aa2.84□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-DR4O74302 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-AP0CX57 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-PR1P0CX58 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-ORP0CX59 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-PR2P0CX60 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-DR5P0CX65 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-ER2P0CX66 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-GR3P0CX67 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-LR1P0CX68 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-MR2P0CX69 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CLB4P24871 460 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W AVT2P39981 480 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SEC28P40509 296 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NEO1P40527 1151 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W AXL1P40851 1208 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-JR2P47099 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SDH1Q00711 640 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-DR1Q03856 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CRR1Q05790 422 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
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