RNA–Protein interactions for RNA: YMR308C

PSE1, Transcript of Karyopherin/importin that interacts with the nuclear pore complex, yeast

Gene PSE1, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSE1	YMR308C	YAP7	Q08182	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	BDS1	Q08347	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PEX3	P28795	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GCS1	P35197	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
PSE1	YMR308C	FAT1	P38225	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	THI6	P41835	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CCC1	P47818	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CTH1	P47976	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	OPT2	Q06593	877 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	HMG2	P12684	1045 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SIR1	P21691	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PER1	P25625	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CIN8	P27895	1000 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YBR062C	P38239	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	STS1	P38637	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MUP3	P38734	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CWC24	P53769	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RIM13	Q03792	727 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NSE1	Q07913	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	OPI10	Q08202	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	FRE3	Q08905	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	HXT4	P32467	576 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CLG1	P35190	452 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	DID4	P36108	232 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NVJ1	P38881	321 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GIP2	P40036	548 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	QDR1	P40475	563 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NIT2	P47016	307 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YGL204C	P53089	101 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MCH5	Q08777	521 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	TCO89	Q08921	799 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RTN2	Q12443	393 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	AI3	P03877	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	TPK1	P06244	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RAM1	P22007	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	VAM7	P32912	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	FIG1	P38224	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	TAE1	P38340	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	AXL2	P38928	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YKE4	P40544	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	GSM1	P42950	618 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	COS4	P43542	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	AGP3	P43548	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MRX6	P48564	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	COG1	P53079	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CTF19	Q02732	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	TMA16	Q08687	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	UAF30	Q08747	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	TOP3	P13099	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	DUT1	P33317	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	KAE1	P36132	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SLI15	P38283	698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YBP1	P38315	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	BZZ1	P38822	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CAB2	P40506	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RFX1	P48743	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	IMA1	P53051	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MET13	P53128	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YGR053C	P53234	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PUS6	P53294	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	STE23	Q06010	1027 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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