RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	MPS1	P54199	764 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	NGL3	Q03210	505 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	GDB1	Q06625	1536 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	ECM30	Q06673	1274 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YDL218W	Q07629	317 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	TEN1	Q07921	160 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	DSE3	Q08729	430 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	SPE4	Q12455	300 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RTP1	Q12751	981 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	PUT2	P07275	575 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	IMG1	P25626	169 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YBR144C	P34215	104 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YBR225W	P38321	900 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	UBA4	P38820	440 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	ANS1	P38832	159 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	ERP2	P39704	215 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YIL060W	P40519	144 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	MRX6	P48564	524 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	DSD1	P53095	428 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YPL068C	Q02749	293 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	MLH2	Q07980	695 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	CAT8	P39113	1433 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	TRM3	Q07527	1436 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	CBS1	P14066	229 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	OCA4	P25366	362 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	SEF1	P34228	1148 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YKL100C	P34248	587 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	NUP133	P36161	1157 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	REG2	P38232	338 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YIL152W	P40455	235 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	SNM1	P40993	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RMD8	P43620	662 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	LCL3	P53153	274 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	VPS75	P53853	264 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RSF1	Q05043	376 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YAP7	Q08182	245 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	SDH5	Q08230	162 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	RDR1	Q08904	546 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	YPT6	Q99260	215 aa		2.97	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	VTH1	P40438	1549 aa		2.96	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	VTH2	P40890	1549 aa		2.96	□□□□□ -1.93
UTP15	YMR093W	MET5	P47169	1442 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
UTP15	YMR093W	SNF3	P10870	884 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	MET8	P15807	274 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	GID7	P25569	745 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	PDR3	P33200	976 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RKM3	P38222	552 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	ARP1	P38696	384 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	CCT6	P39079	546 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	CIN4	P39110	191 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
UTP15	YMR093W	SOL4	P53315	255 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	ESBP6	P53918	673 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RSM23	Q01163	450 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	EKI1	Q03764	534 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	YMR254C	Q04838	102 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	SNA4	Q07549	140 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	YDL144C	Q07589	356 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RTT109	Q07794	436 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	SRL1	Q08673	210 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	CIR2	Q08822	631 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	GCN2	P15442	1659 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	IQG1	Q12280	1495 aa		2.96	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	YFL068W	P0CX99	160 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	SNC1	P31109	117 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	SYN8	P31377	255 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	UBP11	P36026	717 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	ROT2	P38138	954 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	LAG1	P38703	411 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	ALG5	P40350	334 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RTS2	P40962	232 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	BET4	Q00618	327 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	YMR160W	Q03823	816 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	MFB1	Q04922	465 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UTP15	YMR093W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94

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