RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	RER1	P25560	188 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	YOX1	P34161	385 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	ECM15	P35195	104 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	AFG3	P39925	761 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	YJL213W	P40896	331 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	RTT101	P47050	842 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	BSC5	P53755	489 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	RAD30	Q04049	632 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	CDC45	Q08032	650 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	THI20	Q08224	551 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	RSA1	Q08932	381 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	SAN1	P22470	610 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	ATS1	P31386	333 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	CBF2	P32504	956 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	PAH1	P32567	862 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	YKL100C	P34248	587 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	SDS24	P38314	527 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	RPH1	P39956	796 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	SIP4	P46954	829 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	SHR3	Q02774	210 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	CBS2	P14905	389 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	AAC3	P18238	307 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	BOS1	P25385	244 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	BLI1	P35727	113 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	YBP1	P38315	674 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	NPR2	P39923	615 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	FAR3	P46671	204 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	SNG1	P46950	547 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	YDL186W	P48568	277 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	RPM2	Q02773	1202 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	YMR087W	Q04299	284 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SFT1	YKL006C-A	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	PEP5	P12868	1029 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	APE1	P14904	514 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	IMG1	P25626	169 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	AGA1	P32323	725 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	CSM2	P40465	213 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	VTC2	P43585	828 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	EFM6	P53970	246 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RHO4	Q00246	291 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SPC19	Q03954	165 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YDL057W	Q07379	328 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SPC110	P32380	944 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	UBP11	P36026	717 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YBL029W	P38201	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	VPS52	P39904	641 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RPR2	P40571	144 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YJL132W	P47014	750 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	TIM10	P87108	93 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RTT109	Q07794	436 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MRP7	P12687	371 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	MET8	P15807	274 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SYN8	P31377	255 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YBR144C	P34215	104 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YEL068C	P39977	110 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	COS10	P52924	374 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	DSD1	P53095	428 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	RSC1	P53236	928 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	YGR126W	P53274	230 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	AYT1	Q12226	474 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SEM1	O94742	89 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SGF29	P25554	259 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	AVT5	P38176	459 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	ALT2	P52892	507 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SFT1	YKL006C-A	BUD32	P53323	261 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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