RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	REC107	P21651	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	BOS1	P25385	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MDL1	P33310	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	LTP1	P40347	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	IRC7	P43623	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ASI1	P54074	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RMT2	Q03305	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	FIN1	Q03898	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	PIG1	Q06216	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MLH2	Q07980	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	CDC45	Q08032	650 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ISA2	Q12425	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MBR1	P23493	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	DAL80	P26343	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	COQ3	P27680	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YME1	P32795	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	PEX2	P32800	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	PMT1	P33775	817 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	CMC1	P36064	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RPC37	P36121	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YHR131C	P38835	850 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	TWF1	P53250	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RSM23	Q01163	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	CIK1	Q01649	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	TAP42	Q04372	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	FRE3	Q08905	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ARG81	P05085	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	PRD1	P25375	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	DPH2	P32461	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MRE11	P32829	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MIA40	P36046	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	VPS41	P38959	992 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YJL068C	P40363	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SSU1	P41930	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SGF73	P53165	657 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	COQ9	Q05779	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	GAL4	P04386	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MER1	P16523	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	HNM1	P19807	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	NTG1	P31378	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	STB6	P36085	766 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	STV1	P37296	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	HXT14	P42833	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	LAM5	P43560	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	UBP8	P50102	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ADA2	Q02336	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MSC1	Q03104	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RSC9	Q03124	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SWF1	Q04629	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	REX3	Q12090	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RRI1	Q12468	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MNE1	P24720	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ADK2	P26364	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RIB7	P33312	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MSR1	P38714	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	VPS45	P38932	577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	CIN4	P39110	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SEC9	P40357	651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	NMD5	P46970	1048 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YNL144C	P53907	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	PEX25	Q02969	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SEC39	Q12745	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	PUT2	P07275	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	GCS1	P35197	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	ARP1	P38696	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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