RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A SNG1P46950 547 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A IKS1P47042 667 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YGR126WP53274 230 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A RPM2Q02773 1202 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A RBA50Q04418 439 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A GLO2Q05584 274 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CDC45Q08032 650 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A HUA2Q12134 243 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YBR298C-AQ8TGK4 73 aa2.43□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CYB2P00175 591 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A MRS3P10566 314 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PEP5P12868 1029 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A KGD1P20967 1014 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A POL4P25615 582 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YBR144CP34215 104 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A NOP4P37838 685 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A FLC2P39719 783 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A NOP16P40007 231 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CSM2P40465 213 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A VID30P53076 958 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SHR3Q02774 210 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A MSC1Q03104 513 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A NMD4Q12129 218 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SPE4Q12455 300 aa2.42□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CAR1P00812 333 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A MTF1P14908 341 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YHR210CP38893 341 aa2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A CCT6P39079 546 aa2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A YJR154WP47181 346 aa2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A IMP4P53941 290 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A ERP1Q05359 219 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A SGS1P35187 1447 aa2.41□□□□□ -2.02
RPC10YHR143W-A RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A APE1P14904 514 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ART10P18634 518 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YCR007CP25354 239 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A CPR3P25719 182 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A BUD14P27637 709 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A NDC1P32500 655 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PTR2P32901 601 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SEF1P34228 1148 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A UBP11P36026 717 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A VID27P40157 782 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ALG5P40350 334 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ROK1P45818 564 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RTT101P47050 842 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YDL186WP48568 277 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A DSD1P53095 428 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A NGL3Q03210 505 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YMR087WQ04299 284 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SCW10Q04951 389 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YEH1Q07804 573 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YOR365CQ08844 703 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RCN2Q12044 265 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A ENT1Q12518 454 aa2.4□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A MRP13P12686 339 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SGV1P23293 657 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SPC110P32380 944 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A OSH3P38713 996 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YJL213WP40896 331 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.39□□□□□ -2.03not detected
RPC10YHR143W-A LCL3P53153 274 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YGR066CP53242 292 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A BUD32P53323 261 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A FIN1Q03898 291 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YDL057WQ07379 328 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YDR056CQ12025 205 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.39□□□□□ -2.03not detected
RPC10YHR143W-A YDL009CQ12210 107 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YJR112W-AQ3E743 109 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YPT6Q99260 215 aa2.39□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A EST1P17214 699 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A AAC3P18238 307 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SAN1P22470 610 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SHP1P34223 423 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YBP1P38315 674 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A VPS52P39904 641 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A RPH1P39956 796 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TMA108P40462 946 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A YJL132WP47014 750 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A UPF3P48412 387 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A COS10P52924 374 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A IPI3P53877 555 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A TOF2Q02208 771 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A SVL3Q03088 825 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A IVY1Q04934 453 aa2.38□□□□□ -2.03
RPC10YHR143W-A BNA5Q05979 453 aa2.38□□□□□ -2.03
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