RNA–Protein interactions for RNA: YHR089C

GAR1, Transcript of Protein component of the H/ACA snoRNP pseudouridylase complex, yeast

Gene GAR1, Length 618 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAR1	YHR089C	YAL037W	P39728	267 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	ZIM17	P42844	174 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YJR149W	P47177	404 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	GCV1	P48015	400 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	MDM34	P53083	459 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	MRM2	P53123	320 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YDR444W	Q04093	687 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	RAD34	Q06665	692 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YDL121C	Q07541	149 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	PIM1	P36775	1133 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YPS6	P40583	537 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YFR020W	P43600	232 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	CIS3	P47001	227 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YJR154W	P47181	346 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YPL109C	Q02981	657 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	VPS16	Q03308	798 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	VHS1	Q03785	461 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	SUL2	Q12325	893 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	MDM35	O60200	86 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	RED1	P14291	827 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	NPP1	P25353	742 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	SHU2	P38957	223 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	COS12	P53053	380 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YML096W	Q04489	525 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	AI3	P03877	415 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	ARG1	P22768	420 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	INM1	P38710	295 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	MRX1	P40050	688 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	GCD10	P41814	478 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YJR030C	P47101	745 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YDR056C	Q12025	205 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	YLR049C	Q12110	428 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.65	□□□□□ -0.22	not detected
GAR1	YHR089C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	NDE1	P40215	560 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	FKH2	P41813	862 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	ATG29	Q12092	213 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GAR1	YHR089C	EXO70	P19658	623 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	COX13	P32799	129 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.64	□□□□□ -0.23	not detected
GAR1	YHR089C	YNL260C	P53846	198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	ATG34	Q12292	412 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	STT4	P37297	1900 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	COS2	P0CX12	379 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	COS3	P0CX13	379 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	ERV46	P39727	415 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	MET18	P40469	1032 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	COS4	P43542	379 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	HXT16	P47185	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	HXT15	P54854	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	FMN1	Q03778	218 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	IOC2	Q12072	812 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RGT2	Q12300	763 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	GPR1	Q12361	961 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	SRN2	Q99176	213 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	IRA2	P19158	3079 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	AXL2	P38928	823 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	LTP1	P40347	161 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YGL176C	P46945	554 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	SGF73	P53165	657 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	EAF1	Q06337	982 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	OPT2	Q06593	877 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YPR011C	Q12251	326 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	MHT1	Q12525	324 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	SNF5	P18480	905 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	GGC1	P38988	300 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	CEM1	P39525	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	GLO2	Q05584	274 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GAR1	YHR089C	ESA1	Q08649	445 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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