RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	TAH11	P47112	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	MNT2	P53059	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	SPC105	P53148	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	TIM13	P53299	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	EFM6	P53970	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	MFB1	Q04922	465 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	ADH4	P10127	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	CLN1	P20437	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	RBK1	P25332	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	YCL068C	P25593	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	URA10	P30402	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	AEP1	P32493	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	ALY1	P36117	915 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	STN1	P38960	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	RPH1	P39956	796 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	CHA4	P43634	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	EMC4	P53073	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	COG7	P53195	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	GND2	P53319	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	YNL143C	P53908	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	TMA10	Q06177	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	NTG2	Q08214	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	UPC2	Q12151	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	MDM12	Q92328	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	FAB1	P34756	2278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS6	YGR169C	CDC9	P04819	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	GPA2	P10823	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SEC63	P14906	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MRPL25	P23369	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	KAR4	P25583	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	BRF1	P29056	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YME1	P32795	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PEX6	P33760	1030 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	LST4	P34239	828 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MRP21	P38175	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SER33	P40510	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SAP4	P53036	818 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	COG1	P53079	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	AQR1	P53943	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TGL2	P54857	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	NUP100	Q02629	959 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ATP25	Q03153	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TRS31	Q03337	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MCP2	Q06567	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RSC3	Q06639	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	REH1	Q06709	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TGL5	Q12043	749 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YLR358C	O13565	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HEM15	P16622	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SED4	P25365	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PMT1	P33775	817 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	STB6	P36085	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YBR259W	P38338	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MNN1	P39106	762 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SEO1	P39709	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MIC19	P43594	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	NPY1	P53164	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PEX8	P53248	589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SHR3	Q02774	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	UGO1	Q03327	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	NHX1	Q04121	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MSB2	P32334	1306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SEM1	O94742	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ATP12	P22135	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MTC2	P34246	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TOM20	P35180	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ALG8	P40351	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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