RNA–Protein interactions for RNA: YER067W

RGI1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RGI1, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGI1	YER067W	BSC1	Q12140	328 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RGI1	YER067W	MGR1	P25573	417 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YME1	P32795	747 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PMT1	P33775	817 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	VID24	P38263	362 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MSR1	P38714	643 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PHO90	P39535	881 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	FET5	P43561	622 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SNG1	P46950	547 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MDV1	P47025	714 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YGR126W	P53274	230 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	JJJ1	P53863	590 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ATG29	Q12092	213 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.58	□□□□□ -1.84	not detected
RGI1	YER067W	SCM3	Q12334	223 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PRD1	P25375	712 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	BYE1	P36106	594 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SMF1	P38925	575 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	CIN4	P39110	191 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PCI8	P40512	444 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	BOP3	P53958	396 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	BET4	Q00618	327 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SMA1	Q02651	245 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	DIC1	Q06143	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MRE11	P32829	692 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ASK1	P35734	292 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RTS2	P40962	232 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YNL181W	P53878	407 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	FIN1	Q03898	291 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PDS5	Q04264	1277 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MRPL1	Q04599	285 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MLH2	Q07980	695 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RGT2	Q12300	763 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MGM1	P32266	881 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PHD1	P36093	366 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YPK3	P38070	525 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	STB2	P46679	850 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	TWF1	P53250	332 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	TOF2	Q02208	771 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YMR160W	Q03823	816 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SPC19	Q03954	165 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SSK1	Q07084	712 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	THP1	Q08231	455 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	DSE3	Q08729	430 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	AFT2	Q08957	416 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	COR1	P07256	457 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	GID7	P25569	745 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ATO2	P32907	282 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	CMC1	P36064	111 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RKM3	P38222	552 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ERG7	P38604	731 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	LAG1	P38703	411 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PCL6	P40038	420 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YIL152W	P40455	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	HXT14	P42833	540 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SHR3	Q02774	210 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ECI1	Q05871	280 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SNA4	Q07549	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	FMP45	Q07651	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YCR043C	P25361	127 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RPC53	P25441	422 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	PPZ1	P26570	692 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	NFU1	P32860	256 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	EFM2	P38347	419 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YHR210C	P38893	341 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YER130C	P39959	443 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	AXL1	P40851	1208 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	AZF1	P41696	914 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	CDC45	Q08032	650 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RGI1	YER067W	UBX3	Q12229	455 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms