RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SEM1	O94742	89 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SAN1	P22470	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	HOT13	P36078	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YEL068C	P39977	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YNL320W	P42840	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	AAD10	P47182	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	INN1	P53901	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	TAF9	Q05027	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CRN1	Q06440	651 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	MRPS28	P21771	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YBR062C	P38239	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	RTS1	P38903	757 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SLZ1	P40167	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CSM2	P40465	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	BET4	Q00618	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PIG1	Q06216	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	BSP1	Q06604	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SIL1	Q08199	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	RIM15	P43565	1770 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	HXT1	P32465	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	FTH1	P38310	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	POM152	P39685	1337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ALG1	P16661	449 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	AAC3	P18238	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ANP1	P32629	500 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ALY1	P36117	915 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CDC1	P40986	491 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	IME4	P41833	600 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YSA1	Q01976	231 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SKM1	Q12469	655 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	BI2	P03873	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	OM45	P16547	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	BUD14	P27637	709 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	FZO1	P38297	855 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ERV46	P39727	415 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CIN1	P40987	1014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YPR003C	P53394	754 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	INM2	Q05533	292 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ERG11	P10614	530 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	JNM1	P36224	373 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
PRD1	YCL057W	SPL2	P38839	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	NMD5	P46970	1048 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	URB2	P47108	1174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ENT4	Q07872	247 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	DAS2	Q12084	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	MED1	Q12321	566 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	MAK31	P23059	88 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ERP2	P39704	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ASG1	P40467	964 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	RPC17	P47076	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	BTN2	P53286	410 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	INA17	Q02888	182 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	TIP41	Q12199	356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	ENT1	Q12518	454 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRD1	YCL057W	YCR051W	P25631	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	MYO3	P36006	1272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YGL138C	P53122	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RTC4	P53850	401 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YNL144C	P53907	740 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SPC24	Q04477	213 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	FAR8	Q05040	523 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	THI3	Q07471	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	CEX1	Q12453	761 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RPC53	P25441	422 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	UBP13	P38187	747 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YIL001W	P40560	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	KAP114	P53067	1004 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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