RNA–Protein interactions for RNA: YBR167C

POP7, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP7, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP7	YBR167C	YTA12	P40341	825 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YGR126W	P53274	230 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	NGL3	Q03210	505 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YDL057W	Q07379	328 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	CDC45	Q08032	650 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	THI20	Q08224	551 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SDH5	Q08230	162 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SPE4	Q12455	300 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	ENT1	Q12518	454 aa		3.39	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	PEP5	P12868	1029 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	MDM31	P38880	579 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	VID27	P40157	782 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	BUD32	P53323	261 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	MSC1	Q03104	513 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YKU80	Q04437	629 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SCW10	Q04951	389 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	PPT2	Q12036	173 aa		3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	CYB2	P00175	591 aa		3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	PAH1	P32567	862 aa		3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	PTR2	P32901	601 aa		3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	CIN4	P39110	191 aa		3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	DSD1	P53095	428 aa		3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	RIP-Chip
POP7	YBR167C	IPI3	P53877	555 aa		3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.37	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	APE1	P14904	514 aa		3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	NDC1	P32500	655 aa		3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	KRE9	P39005	276 aa		3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	VPS52	P39904	641 aa		3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	CSM2	P40465	213 aa		3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	RTT101	P47050	842 aa		3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SET6	Q12529	373 aa		3.36	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	MRP13	P12686	339 aa		3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	ATS1	P31386	333 aa		3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SEF1	P34228	1148 aa		3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	ALG5	P40350	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	ALT2	P52892	507 aa		3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	VID30	P53076	958 aa		3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YDR056C	Q12025	205 aa		3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	AAC3	P18238	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	SAN1	P22470	610 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	BUD14	P27637	709 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	CCT6	P39079	546 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	FLC2	P39719	783 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	RPH1	P39956	796 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YJL213W	P40896	331 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	RPM2	Q02773	1202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	YEH1	Q07804	573 aa		3.34	□□□□□ -1.87
POP7	YBR167C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
POP7	YBR167C	SEM1	O94742	89 aa		3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	CPR3	P25719	182 aa		3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	YHR210C	P38893	341 aa		3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
POP7	YBR167C	YJR154W	P47181	346 aa		3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	COQ9	Q05779	260 aa		3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	NMD4	Q12129	218 aa		3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	YPT6	Q99260	215 aa		3.33	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	PEP3	P27801	918 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	AGA1	P32323	725 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	FRE1	P32791	686 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	REG2	P38232	338 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	YHR218W	P38899	603 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	NPR2	P39923	615 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	TMA108	P40462	946 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	RPR2	P40571	144 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	YDL186W	P48568	277 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	IVY1	Q04934	453 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	THP1	Q08231	455 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.32	□□□□□ -1.88
POP7	YBR167C	RCN2	Q12044	265 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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