RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 LAMA3Q16787 3333 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ACLYP53396 1101 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 GPR153Q6NV75 609 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 KATNBL1Q9H079 304 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 KAT14Q9H8E8 782 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 SZT2Q5T011 3432 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 B4E1Z4 1266 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 GJA9P57773 515 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 TLE2Q04725 743 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNA10Q16322 511 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 PNMA1Q8ND90 353 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 STARD7Q9NQZ5 370 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 LAMA4Q16363 1823 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 NKX3-2P78367 333 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 TNFAIP2Q03169 654 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 LRCH3Q96II8 777 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 TOX2Q96NM4 488 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ELP1O95163 1332 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 MCM3APO60318 1980 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 CLTBP09497 229 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 GNASQ5JWF2 1037 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 MORC4Q8TE76 937 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 VTA1Q9NP79 307 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ASTN1O14525 1302 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 TNKSO95271 1327 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRVP-204ENST00000639439 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 MYADML2A6NDP7 307 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 NFIBO00712 420 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 ADCY6O43306 1168 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 CHMLP26374 656 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 TRDNQ13061 729 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 MAF1Q9H063 256 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 IL25Q9H293 177 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 DCDC2CA8MYV0 355 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 ASGR1P07306 291 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 CLEC4DQ8WXI8 215 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 AP5M1Q9H0R1 490 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 Q9Y3F1 56 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 KIAA0355O15063 1070 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 ZEB2O60315 1214 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 CABYRO75952 493 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 TAPT1Q6NXT6 567 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 TLK2Q86UE8 772 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 RGS22Q8NE09 1264 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 BADQ92934 168 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 B4DLN1 442 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 RAG1P15918 1043 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 CALML3P27482 149 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 RPS6P62753 249 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 EEPD1Q7L9B9 569 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 DNERQ8NFT8 737 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 ARVCFO00192 962 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 CTAGE5O15320 804 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 SGSM2O43147 1006 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 SMPD1P17405 629 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 CDK7P50613 346 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-204ENST00000639439 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms