RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638514.1

KCNMA1-238, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene KCNMA1, Length 3,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNMA1-238	ENST00000638514	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TJP1	Q07157	1748 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SLC5A1	P13866	664 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TNFRSF8	P28908	595 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	DNM2	P50570	870 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	GUCY1A3	Q02108	690 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	APBA1	Q02410	837 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TCIRG1	Q13488	830 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PLCB4	Q15147	1175 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CCDC96	Q2M329	555 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CFAP58	Q5T655	872 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	NUP58	Q9BVL2	599 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	KIF1A	Q12756	1690 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	LRP6	O75581	1613 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	KRT14	P02533	472 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CENPH	Q9H3R5	247 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PPP1R37	O75864	691 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PRLR	P16471	622 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CDR1	P51861	262 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PTGIS	Q16647	500 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TTC38	Q5R3I4	469 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	C8orf74	Q6P047	294 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TMTC2	Q8N394	836 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	MTR	Q99707	1265 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	WNT7A	O00755	349 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ZBED6	P86452	979 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PTGDR	Q13258	359 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514		F8W031	263 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PRKAB2	O43741	272 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	NR1D1	P20393	614 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PAFAH1B1	P43034	410 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	NLRP14	Q86W24	1093 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	THAP9	Q9H5L6	903 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	VEZT	Q9HBM0	779 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	POLD4	Q9HCU8	107 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514		B4DLN1	442 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SRGN	P10124	158 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	IFT88	Q13099	833 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	RETREG2	Q8NC44	543 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SHISA4	Q96DD7	197 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TRIM47	Q96LD4	638 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	EXOC1	Q9NV70	894 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	RASSF9	O75901	435 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	RCAN1	P53805	252 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ADSSL1	Q8N142	457 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	CCDC42	Q96M95	316 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	GYG1	P46976	350 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	INHBE	P58166	350 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	GGA2	Q9UJY4	613 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	DRP2	Q13474	957 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	IFT20	Q8IY31	132 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PLIN2	Q99541	437 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	IQCK	Q8N0W5	287 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	PSMB7	Q99436	277 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	SH2D4A	Q9H788	454 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNMA1-238	ENST00000638514	ZNF233	A6NK53	670 aa		15.15	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms