RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB2-208	ENST00000614825	CALML3	P27482	149 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	ACLY	P53396	1101 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	KCNA10	Q16322	511 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	USH1G	Q495M9	461 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	IL25	Q9H293	177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	NFIB	O00712	420 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	ADCY6	O43306	1168 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	BEX3	Q00994	111 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	BAD	Q92934	168 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	KRT23	Q9C075	422 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	PTGS1	P23219	599 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	TNKS	O95271	1327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-208	ENST00000614825	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	ASGR1	P07306	291 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CLTB	P09497	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CHML	P26374	656 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	TRDN	Q13061	729 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	SNX17	Q15036	470 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	ASTN1	O14525	1302 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	RAG1	P15918	1043 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	GJA9	P57773	515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	PTH1R	Q03431	593 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825		Q7L0L9	218 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	RAD50	Q92878	1312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	SMPD1	P17405	629 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	PDE4D	Q08499	809 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	NT5C2	P49902	561 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	SHH	Q15465	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-208	ENST00000614825	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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